2025
Journal articles
- titre
- Impact of Explanation Technique and Representation on Users’ Comprehension and Confidence in Explainable AI
- auteur
- Julien Delaunay, Luis Galárraga, Christine Largouët, Niels Van Berkel
- article
- Proceedings of the ACM on Human-Computer Interaction , 2025, 9 (2), pp.Article CSCW113. ⟨10.1145/3711011⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- MUSET: set of utilities for constructing abundance unitig matrices from sequencing data [sequence analysis]
- auteur
- Riccardo Vicedomini, Francesco Andreace, Yoann Dufresne, Rayan Chikhi, Camila Duitama González
- article
- Bioinformatics, 2025, 41 (3), pp.1-5. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf054⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The Silene latifolia genome and its giant Y chromosome
- auteur
- Carol Moraga, Catarina Branco, Quentin Rougemont, Paris Veltsos, Pavel Jedlička, Aline Muyle, Mélissa Hanique, Eric Tannier, Xiaodong Liu, Eddy Mendoza-Galindo, Claire Lemaitre, Peter D. Fields, Corinne Cruaud, Karine Labadie, Caroline Belser, Jérôme Briolay, Sylvain Santoni, Radim Cegan, Raquel Linheiro, Ricardo C. Rodríguez de la Vega, Gabriele Adam, Adil El Filali, Vinciane Mossion, Adnane Boualem, Raquel Tavares, Amine Chebbi, Richard Cordaux, Cécile Fruchard, Djivan Prentout, Amandine Velt, Bruno Spataro, Stephane Delmotte, Laura Weingartner, Helena Toegelová, Zuzana Tulpová, Petr Cápal, Hana Šimková, Helena Štorchová, Manuela Krüger, Oushadee A. J. Abeyawardana, Douglas R. Taylor, Matthew S. Olson, Daniel B. Sloan, Sophie Karrenberg, Lynda F. Delph, Deborah Charlesworth, Tatiana Giraud, Abdelhafid Bendahmane, Alex Di Genova, Mohammed‐Amin Madoui, Roman Hobza, Gabriel Marais
- article
- Science, 2025, 387 (6734), pp.630-636. ⟨10.1126/science.adj7430⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Pervasive formation of double-stranded RNAs by overlapping sense/antisense transcripts in budding yeast mitosis and meiosis
- auteur
- Ugo Szachnowski, Emmanuelle Becker, Igor Stuparevic, Maxime Wery, Olivier Sallou, Matéo Boudet, Anthony Bretaudeau, Antonin Morillon, Michael Primig
- article
- RNA, 2025, pp.rna.080290.124. ⟨10.1261/rna.080290.124⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Predicting Parkinson’s disease trajectory using clinical and functional MRI features: a reproduction and replication study
- auteur
- Elodie Germani, Nikhil Baghwat, Mathieu Dugré, Rémi Gau, Albert Montillo, Kevin Nguyen, Andrzej Sokolowski, Madeleine Sharp, Jean-Baptiste Poline, Tristan Glatard
- article
- PLoS ONE, 2025, pp.1-39. ⟨10.1371/journal.pone.0317566⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Transposable element accumulation drives genome size increase in Hylesia metabus (Lepidoptera: Saturniidae), an urticating moth species from South America
- auteur
- Charles Perrier, Rémi Allio, Fabrice Legeai, Mathieu Gautier, Frédéric Bénéluz, William Marande, Anthony Théron, Nathalie Rodde, Melfran Herrera, Laure Saune, Hugues Parrinello, Mélanie Mcclure, Mónica Arias
- article
- Journal of Heredity, In press, pp.esae069. ⟨10.1093/jhered/esae069⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Conference papers
- titre
- ACUITEE: A Comprehensive Tool for Visualization, Editing and Curating textual Annotations in Clinical Data
- auteur
- Moussa Baddour, Olivier Dameron, Marie de Tayrac, Stéphane Paquelet, Paul Rollier, Thomas Labbé, Majd Saleh
- article
- EECSS 2025 – 11th World Congress on Electrical Engineering and Computer Systems and Sciences, Aug 2025, Paris, France. pp.1-9
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Learning from Teachers: AI-Driven Feedback for a High School Python Serious Game
- auteur
- Matthieu Branthôme, Sébastien Lallé
- article
- The 12th 2025 ACM Learning @ Scale Conference, Jul 2025, Palermo, Italy. ⟨10.1145/3698205.3729543⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Low-Cost Privacy-Preserving Decentralized Learning
- auteur
- Sayan Biswas, Davide Frey, Romaric Gaudel, Anne-Marie Kermarrec, Dimitri Lerévérend, Rafael Pires, Rishi Sharma, François Taïani
- article
- PETS 2025 – 25th Privacy Enhancing Technologies Symposium, Jul 2025, Washinghton DC, United States. pp.1-4, ⟨10.56553/popets-2025-0001⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Mitigating analytical variability in fMRI results with style transfer
- auteur
- Elodie Germani, Camille Maumet, Elisa Fromont
- article
- Medical Imaging with Deep Learning (MIDL 2025), Jul 2025, Salt Lake City (US), United States
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Fuzzy Retrieval of Musical Scores Based on Melodic Patterns
- auteur
- Adel Aly, Olivier Pivert, Virginie Thion
- article
- FUZZ-IEEE 2025 – IEEE International Conference on Fuzzy Systems, Jul 2025, Reims, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Impact of Adaptive Feedback on Learning Programming with a Serious Game in High Schools’ Classes
- auteur
- Matthieu Branthôme, Sébastien Lallé
- article
- 33rd ACM Conference on User Modeling, Adaptation and Personalization (UMAP ’25), Jun 2025, New York, NY, United States. ⟨10.1145/3699682.3728326⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- A Flexible Framework for Transposition-Aware Querying of a Musical Score Database
- auteur
- Adel Aly, Olivier Pivert, Virginie Thion
- article
- Research Challenges in Information Science (RCIS’25), May 2025, Seville, Spain
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Synthetic Tabular Data Detection In the Wild
- auteur
- G. Charbel N. Kindji, Elisa Fromont, Lina Maria Rojas-Barahona, Tanguy Urvoy
- article
- International Symposium on Intelligent Data Analysis, May 2025, Konstanz, Germany
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Maelis4Skrid: an Approximate Query Engine for an Online Graph-Based Musical Score Library
- auteur
- Adel Aly, Olivier Pivert, Virginie Thion
- article
- Companion Proceedings of the ACM Web Conference 2025, WWW 2025, Apr 2025, Sydney, Australia. ⟨10.1145/3701716.3715185⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- One for all and all for one: Efficient Computation of Partial Wasserstein Distances on the Line
- auteur
- Laetitia Chapel, Romain Tavenard
- article
- International Conference on Learning Representations, Apr 2025, Singapore, Singapore
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Détection et segmentation des anomalies cérébrales post-AVC
- auteur
- Youwan Mahé, Stéphanie Leplaideur, Elisa Fromont, Elise Bannier, Francesca Galassi
- article
- IABM 2025 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale, Mar 2025, Nice, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- A PAC-Bayesian Link Between Generalisation and Flat Minima
- auteur
- Maxime Haddouche, Paul Viallard, Umut Şimşekli, Benjamin Guedj
- article
- ALT 2025 – 36th International Conference on Algorithmic Learning Theory, Feb 2025, Milan, Italy. pp.1-31
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- De nouveaux outils et algorithmes au service de la mesure du bien-être des animaux face au changement climatique
- auteur
- Florence Gondret, Claire Verplanck, Romain Lardy, Masoomeh Taghipoor, Mathieu Bonneau, Alexandre Termier
- article
- 2025 – Journées scientifiques du programme PEPR Agroécologie et Numérique, PEPR agroécologie et numérique, Jan 2025, Dijon (FR), France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Cross-table Synthetic Tabular Data Detection
- auteur
- G. Charbel N. Kindji, Lina Maria Rojas-Barahona, Elisa Fromont, Tanguy Urvoy
- article
- COLING 2025 – Workshop on Detecting AI Generated Content at COLING, Jan 2025, Abu dahbi, United Arab Emirates. pp.1-7
- typdoc
- Conference papers
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-
2024
Journal articles
- titre
- Generic and queryable data integration schema for transcriptomics and epigenomics studies
- auteur
- Yael Tirlet, Matéo Boudet, Emmanuelle Becker, Fabrice Legeai, Olivier Dameron
- article
- Computational and Structural Biotechnology Journal, 2024, 23, pp.4232-4241. ⟨10.1016/j.csbj.2024.11.022⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Uniform Generalization Bounds on Data-Dependent Hypothesis Sets via PAC-Bayesian Theory on Random Sets
- auteur
- Benjamin Dupuis, Paul Viallard, George Deligiannidis, Umut Şimşekli
- article
- Journal of Machine Learning Research, 2024
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Rapid inference of antibiotic susceptibility phenotype of uropathogens using metagenomic sequencing with neighbor typing
- auteur
- Amanda C Carroll, Leanne Mortimer, Hiren Ghosh, Sandra Reuter, Hajo Grundmann, Karel Brinda, William P Hanage, Angel Li, Aimee Paterson, Andrew Purssell, Ashley Rooney, Noelle R Yee, Bryan Coburn, Shola Able-Thomas, Martin Antonio, Allison Mcgeer, Derek R Macfadden
- article
- Microbiology Spectrum, 2024, pp.1-16. ⟨10.1128/spectrum.01366-24⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- QRLIT: Quantum Reinforcement Learning for Database Index Tuning
- auteur
- Diogo Barbosa, Le Gruenwald, Laurent D Orazio, Jorge Bernardino
- article
- Future internet, 2024, 16 (12), ⟨10.3390/fi16120439⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- BioPAX in 2024: Where we are and where we are heading
- auteur
- Cécile Beust, Emmanuelle Becker, Nathalie Théret, Olivier Dameron
- article
- Computational and Structural Biotechnology Journal, 2024, 23, pp.3999-4010. ⟨10.1016/j.csbj.2024.10.045⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- HeROsim: An Allocation and Scheduling Simulator for Evaluating Serverless Orchestration Policies
- auteur
- Vincent Lannurien, Laurent D’orazio, Olivier Barais, Stéphane Paquelet, Jalil Boukhobza
- article
- IEEE Internet Computing, 2024, 28 (6), pp.8-16. ⟨10.1109/MIC.2024.3511332⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- CRI : A Competent Reader Imitator for detecting binomial names in an historical corpus
- auteur
- Clément Morand, Olivier Ridoux
- article
- Lingvisticae investigationes : International Journal of Linguistics and Language, 2024, 47 (1), pp.30-67. ⟨10.1075/li.00107.mor⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Back to sequences: Find the origin of k-mers
- auteur
- Anthony Baire, Pierre Marijon, Francesco Andreace, Pierre Peterlongo
- article
- Journal of Open Source Software, 2024, 9 (101), pp.7066. ⟨10.21105/joss.07066⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The Galaxy platform for accessible, reproducible, and collaborative data analyses: 2024 update
- auteur
- Linelle Ann L Abueg, Enis Afgan, Olivier Allart, Ahmed Awan, Wendi Bacon, Dannon Baker, Madeline Bassetti, Bérénice Batut, Matthias Bernt, Daniel Blankenberg, Aureliano Bombarely, Anthony Bretaudeau, Catherine Bromhead, Melissa Burke, Patrick Capon, Martin Čech, María Chavero-Díez, John Chilton, Tyler Collins, Frederik Coppens, Nate Coraor, Gianmauro Cuccuru, Fabio Cumbo, John Davis, Paul de Geest, Willem de Koning, Martin Demko, Assunta Desanto, José Manuel Domínguez Begines, Maria Doyle, Bert Droesbeke, Anika Erxleben-Eggenhofer, Melanie Föll, Giulio Formenti, Anne Fouilloux, Rendani Gangazhe, Tanguy Genthon, Jeremy Goecks, Alejandra Beltran, Nuwan Goonasekera, Nadia Goué, Timothy Griffin, Björn Grüning, Aysam Guerler, Sveinung Gundersen, Ove Johan Ragnar Gustafsson, Christina Hall, Thomas Harrop, Helge Hecht, Alireza Heidari, Tillman Heisner, Florian Heyl, Saskia Hiltemann, Hans-Rudolf Hotz, Cameron Hyde, Pratik Jagtap, Julia Jakiela, James Johnson, Jayadev Joshi, Marie Jossé, Khaled Jum’ah, Matúš Kalaš, Katarzyna Kamieniecka, Tunc Kayikcioglu, Markus Konkol, Leonid Kostrykin, Natalie Kucher, Anup Kumar, Mira Kuntz, Delphine Lariviere, Ross Lazarus, Yvan Le Bras, Gildas Le Corguillé, Justin Lee, Simone Leo, Leandro Liborio, Romane Libouban, David López Tabernero, Lucille Lopez-Delisle, Laila Los, Alexandru Mahmoud, Igor Makunin, Pierre Marin, Subina Mehta, Winnie Mok, Pablo Moreno, François Morier-Genoud, Stephen Mosher, Teresa Müller, Engy Nasr, Anton Nekrutenko, Tiffanie Nelson, Asime Oba, Alexander Ostrovsky, Polina Polunina, Krzysztof Poterlowicz, Elliott Price, Gareth Price, Helena Rasche, Bryan Raubenolt, Coline Royaux, Luke Sargent, Michelle Savage, Volodymyr Savchenko, Denys Savchenko, Michael Schatz, Pauline Seguineau, Beatriz Serrano-Solano, Nicola Soranzo, Sanjay Kumar Srikakulam, Keith Suderman, Anna Syme, Marco Antonio Tangaro, Jonathan Tedds, Mehmet Tekman, Anil Thanki, Michael Uhl, Marius van den Beek, Deepti Varshney, Jenn Vessio, Pavankumar Videm, Greg von Kuster, Gregory Watson, Natalie Whitaker-Allen, Uwe Winter, Martin Wolstencroft, Federico Zambelli, Paul Zierep, Rand Zoabi
- article
- Nucleic Acids Research, 2024, 52 (W1), pp.W83-W94. ⟨10.1093/nar/gkae410⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Multiple deletions of candidate effector genes lead to the breakdown of partial grapevine resistance to downy mildew
- auteur
- Manon Paineau, Andrea Minio, Pere Mestre, Frédéric Fabre, Isabelle D Mazet, Carole Couture, Fabrice Legeai, Thomas Dumartinet, Dario Cantu, François Delmotte
- article
- New Phytologist, 2024, 243 (4), pp.1490-1505. ⟨10.1111/nph.19861⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Combined cytogenetic and molecular methods for taxonomic verification and description of Brassica populations deriving from different origins
- auteur
- Cyril Falentin, Houria Hadj-Arab, Fella Aissiou, Claudia Bartoli, Giuseppe Bazan, Matéo Boudet, Lydia Bousset-Vaslin, Marwa Chwikhi, Olivier Coriton, Gwénaelle Deniot, Julie Ferreira de Carvalho, Laurène Gay, Anna Geraci, Pascal Glory, Virginie Huteau, Riadh Ilahy, Vincenzo Ilardi, José A. Jarillo, Vladimir Meglic, Elisabetta Oddo, Monica Pernas, Manuel Pineiro, Barbara Pipan, Thouraya Rhim, Vincent Richer, Fulvia Rizza, Joelle Ronfort, Mathieu Rousseau-Gueutin, Rosario Schicchi, Lovro Sinkovic, Maryse Taburel, Valeria Terzi, Sylvain Théréné, Mathieu Tiret, Imen Tlili, Marie-Hélène Wagner, Franz Werner Badeck, Anne-Marie Chèvre
- article
- Genetic Resources, 2024, 5 (9), pp.61-71. ⟨10.46265/genresj.ryaj6068⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Identification of a viral gene essential for the genome replication of a domesticated endogenous virus in ichneumonid parasitoid wasps
- auteur
- Ange Lorenzi, Fabrice Legeai, Véronique Jouan, Pierre-Alain Girard, Michael R Strand, Marc Ravallec, Magali Eychenne, Anthony Bretaudeau, Stéphanie Robin, Jeanne Rochefort, Mathilde Villegas, Gaelen R Burke, Rita Rebollo, Nicolas Nègre, Anne-Nathalie Volkoff
- article
- PLoS Pathogens, 2024, 20 (4), pp.e1011980. ⟨10.1371/journal.ppat.1011980⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Leveraging an Isolation Forest to Anomaly Detection and Data Clustering
- auteur
- Véronne Yepmo, Grégory Smits, Marie-Jeanne Lesot, Olivier Pivert
- article
- Data and Knowledge Engineering, 2024, 151, pp.102302. ⟨10.1016/j.datak.2024.102302⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Proceedings of the OHBM Brainhack 2022
- auteur
- Stefano Moia, Hao-Ting Wang, Anibal S. Heinsfeld, Dorota Jarecka, Yu Fang Yang, Stephan Heunis, Michele Svanera, Benjamin De Leener, Andrea Gondová, Sin Kim, Arshitha Basavaraj, Johanna M. M. Bayer, Roza G. Bayrak, Pierre-Louis Bazin, Isil Poyraz Bilgin, Steffen Bollmann, Daniel Borek, Valentina Borghesani, Trang Cao, Gang Chen, Alejandro de La Vega, Sebastian Dresbach, Philipp Ehses, Jan Ernsting, Inês Esteves, Oscar Ferrante, Kelly G. Garner, Rémi Gau, Elodie Germani, Tara Ghafari, Satrajit S. Ghosh, Sarah E. Goodale, Cassandra D. Gould Van Praag, Samuel Guay, Omer Faruk Gulban, Yaroslav O. Halchenko, Michael Hanke, Peer Herholz, Katja Heuer, Felix Hoffstaedter, Ruoqi Huang, Renzo Huber, Ole Jensen, Kan Keeratimahat, Julian Q. Kosciessa, Sladjana Lukic, Neville Magielse, Christopher J. Markiewicz, Caroline G. Martin, Camille Maumet, Anna Menacher, Jeff Mentch, Christian Mönch, Shammi More, Leonardo Muller, Leonardo Muller-Rodriguez, Samuel A. Nastase, Eliana Nicolaisen-Sobesky, Dylan M. Nielson, Christopher R. Nolan, François Paugam, Pedro Pinheiro-Chagas, Ana Luísa Pinho, Alessandra Pizzuti, Benjamin Poldrack, Benedikt A. Poser, Roberta Rocca, Jacob Sanz-Robinson, Kelvin Sarink, Kevin R Sitek, Nadine Spychala, Rüdiger Stirnberg, Michał Szczepanik, Mohammad Torabi, Roberto Toro, Sebastian G. W. Urchs, Sofie L. Valk, Adina S Wagner, Laura K. Waite, Alexander Q. Waite, Lea Waller, Tyler J. Wishard, Jianxiao Wu, Yuchen Zhou, Janine D. Bijsterbosch
- article
- Aperture Neuro, 2024, ⟨10.52294/001c.92760⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparing machine-learning models of different levels of complexity for crop protection: A look into the complexity-accuracy tradeoff
- auteur
- Olivier Gauriau, Luis Galárraga, François Brun, Alexandre Termier, Loïc Davadan, François Joudelat
- article
- Smart Agricultural Technology, 2024, 7, pp.100380. ⟨10.1016/j.atech.2023.100380⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Chromosome-Level Assembly and Annotation of the Pearly Heath Coenonympha arcania Butterfly Genome
- auteur
- Fabrice Legeai, Sandra Romain, Thibaut Capblancq, Paul Doniol-Valcroze, Mathieu Joron, Claire Lemaitre, Laurence Després
- article
- Genome Biology and Evolution, 2024, 16 (3), pp.evae055. ⟨10.1093/gbe/evae055⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Indexer des milliards d’éléments avec les filtres de Bloom
- auteur
- Pierre Peterlongo, Lucas Robidou
- article
- Interstices, 2024, pp.1-6
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Indexing and real-time user-friendly queries in terabyte-sized complex genomic datasets with kmindex and ORA
- auteur
- Téo Lemane, Nolan Lezzoche, Julien Lecubin, Eric Pelletier, Magali Lescot, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- Nature Computational Science, 2024, 4 (2), pp.104-109. ⟨10.1038/s43588-024-00596-6⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Indexer les données génomiques : un défi de taille à relever
- auteur
- Téo Lemane, Magali Lescot, Pierre Peterlongo
- article
- Interstices, 2024, pp.1-5
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Transcriptomic basis of sex loss in the pea aphid
- auteur
- M D Huguet, Stéphanie Robin, Sylvie Hudaverdian, Sylvie Tanguy, Nathalie Prunier-Leterme, Romuald Cloteau, Sylvain Baulande, Patricia Legoix-Né, Fabrice Legeai, Jean-Christophe Simon, Julie Jaquiéry, Denis Tagu, Gaël Le Trionnaire
- article
- BMC Genomics, 2024, Bmc Genomics, 25 (1), pp.202. ⟨10.1186/s12864-023-09776-6⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Backpack Quotient Filter: a dynamic and space-efficient data structure for querying k -mers with abundance
- auteur
- Victor Levallois, Francesco Andreace, Bertrand Le Gal, Yoann Dufresne, Pierre Peterlongo
- article
- iScience, 2024, pp.111435. ⟨10.1016/j.isci.2024.111435⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HairSplitter: haplotype assembly from long, noisy reads
- auteur
- Roland Faure, Dominique Lavenier, Jean-François Flot
- article
- Peer Community In Mathematical and Computational Biology, 2024, pp.1-16. ⟨10.1101/2024.02.13.580067⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Global exact optimisations for chloroplast structural haplotype scaffolding
- auteur
- Victor Epain, Rumen Andonov
- article
- Algorithms for Molecular Biology, 2024, 19 (5), pp.1-35. ⟨10.1186/s13015-023-00243-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genomic insights into Spiroplasma endosymbionts that induce male-killing and protective phenotypes in the pea aphid
- auteur
- Hiroshi Arai, Fabrice Legeai, Daisuke Kageyama, Akiko Sugio, Jean-Christophe Simon
- article
- FEMS Microbiology Letters, 2024, 371, ⟨10.1093/femsle/fnae027⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Analyzing and explaining privacy risks on time series data: ongoing work and challenges
- auteur
- Tristan Allard, Hira Asghar, Gildas Avoine, Christophe Bobineau, Pierre Cauchois, Elisa Fromont, Anna Monreale, Francesca Naretto, Roberto Pellungrini, Francesca Pratesi, Marie-Christine Rousset, Antonin Voyez
- article
- SIGKDD explorations : newsletter of the Special Interest Group (SIG) on Knowledge Discovery & Data Mining, In press, 26 (1), pp.1-10. ⟨10.1145/3682112.3682118⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The 5-Fluorouracil RNA Expression Viewer (5-FUR) Facilitates Interpreting the Effects of Drug Treatment and RRP6 Deletion on the Transcriptional Landscape in Yeast
- auteur
- Ugo Szachnowski, Oliver Sallou, Matéo Boudet, Anthony Bretaudeau, Maxime Wéry, Antonin Morillon, Michael Primig
- article
- Yeast, 2024, 41 (10), pp.629-640. ⟨10.1002/yea.3982⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidential uncertainty sampling for active learning
- auteur
- Arthur Hoarau, Vincent Lemaire, Yolande Le Gall, Jean-Christophe Dubois, Arnaud Martin
- article
- Machine Learning, 2024
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Regulus infers signed regulatory relations from few samples' information using discretization and likelihood constraints
- auteur
- Marine Louarn, Guillaume Collet, Eve Barre, Thierry Fest, Olivier Dameron, Anne Siegel, Fabrice Chatonnet
- article
- PLoS Computational Biology, 2024, 20 (1), pp.e1011816. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011816⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SPARTA: Interpretable functional classification of microbiomes and detection of hidden cumulative effects
- auteur
- Baptiste Ruiz, Arnaud Belcour, Samuel Blanquart, Sylvie Buffet-Bataillon, Isabelle Luron Le Huërou-Luron, Anne Siegel, Yann Le Cunff
- article
- PLoS Computational Biology, 2024, 20 (11), pp.e1012577. ⟨10.1371/journal.pcbi.1012577⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A rule-based multiscale model of hepatic stellate cell plasticity: Critical role of the inactivation loop in fibrosis progression
- auteur
- Matthieu Bouguéon, Vincent Legagneux, Octave Hazard, Jeremy Bomo, Anne Siegel, Jerome Feret, Nathalie Théret
- article
- PLoS Computational Biology, 2024, 20 (7), pp.e1011858. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011858⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fully in vitro iterative construction of a 24 kb-long artificial DNA sequence to store digital information
- auteur
- Julien Leblanc, Olivier Boulle, Emeline Roux, Jacques Nicolas, Dominique Lavenier, Yann Audic
- article
- Biotechniques, 2024, 76 (5), pp.203-215. ⟨10.2144/btn-2023-0109⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems
- auteur
- France Denoeud, Olivier Godfroy, Corinne Cruaud, Svenja Heesch, Zofia Nehr, Nachida Tadrent, Arnaud Couloux, Loraine Brillet-Guéguen, Ludovic Delage, Dean Mckeown, Taizo Motomura, Duncan Sussfeld, Xiao Fan, Lisa Mazéas, Nicolas Terrapon, Josué Barrera-Redondo, Romy Petroll, Lauric Reynes, Seok-Wan Choi, Jihoon Jo, Kavitha Uthanumallian, Kenny Bogaert, Céline Duc, Pélagie Ratchinski, Agnieszka Lipinska, Benjamin Noel, Eleanor Murphy, Martin Lohr, Ananya Khatei, Pauline Hamon-Giraud, Christophe Vieira, Komlan Avia, Svea Sanja Akerfors, Shingo Akita, Yacine Badis, Tristan Barbeyron, Arnaud Belcour, Wahiba Berrabah, Samuel Blanquart, Ahlem Bouguerba-Collin, Trevor Bringloe, Rose Ann Cattolico, Alexandre Cormier, Helena Cruz de Carvalho, Romain Dallet, Olivier de Clerck, Ahmed Debit, Erwan Denis, Christophe Destombe, Erica Dinatale, Simon Dittami, Elodie Drula, Sylvain Faugeron, Jeanne Got, Louis Graf, Agnès Groisillier, Marie-Laure Guillemin, Lars Harms, William John Hatchett, Bernard Henrissat, Galice Hoarau, Chloé Jollivet, Alexander Jueterbock, Ehsan Kayal, Andrew Knoll, Kazuhiro Kogame, Arthur Le Bars, Catherine Leblanc, Line Le Gall, Ronja Ley, Xi Liu, Steven Loduca, Pascal Jean Lopez, Philippe Lopez, Eric Manirakiza, Karine Massau, Stéphane Mauger, Laetitia Mest, Gurvan Michel, Catia Monteiro, Chikako Nagasato, Delphine Nègre, Eric Pelletier, Naomi Phillips, Philippe Potin, Stefan Rensing, Ellyn Rousselot, Sylvie Rousvoal, Declan Schroeder, Delphine Scornet, Anne Siegel, Leila Tirichine, Thierry Tonon, Klaus Valentin, Heroen Verbruggen, Florian Weinberger, Glen Wheeler, Hiroshi Kawai, Akira Peters, Hwan Su Yoon, Cécile Hervé, Naihao Ye, Eric Bapteste, Myriam Valero, Gabriel Markov, Erwan Corre, Susana Coelho, Patrick Wincker, Jean-Marc Aury, J. Mark Cock
- article
- Cell, In press, 187 (24), pp.6943-+. ⟨10.1016/j.cell.2024.10.049⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Identification of transcriptional modules linked to the drought response of Brassica napus during seed development and their mitigation by early biotic stress
- auteur
- Grégoire Bianchetti, Vanessa Clouet, Fabrice Legeai, Cécile Baron, Kévin Gazengel, Benoît Ly Vu, Sébastien Baud, Alexandra To, Maria J Manzanares-Dauleux, Julia Buitink, Nathalie Nesi
- article
- Physiologia Plantarum, 2024, Physiologia Plantarum, 176 (1), pp.e14130. ⟨10.1111/ppl.14130⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Exploration de partitions musicales modélisées sous forme de graphe
- auteur
- Philippe Rigaux, Virginie Thion
- article
- Revue ouverte d’ingénierie des systèmes d’information, 2024, 4 (2), ⟨10.21494/ISTE.OP.2024.1193⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Empirical evidence for metabolic drift in plant and algal lipid biosynthesis pathways
- auteur
- Maëlle Zonnequin, Arnaud Belcour, Ludovic Delage, Anne Siegel, Samuel Blanquart, Catherine Leblanc, Gabriel V Markov
- article
- Frontiers in Plant Science, 2024, 15, pp.1339132. ⟨10.3389/fpls.2024.1339132⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Expliquer une boîte noire sans boîte noire
- auteur
- Julien Delaunay, Luis Galárraga, Christine Largouët
- article
- Revue TAL : traitement automatique des langues, 2024, 64 (3/2023), pp.93-117
- typdoc
- Journal articles
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-
Conference papers
- titre
- MiMyCS: A Processing-in-Memory Read Mapper for Compressing Next-Gen Sequencing Datasets
- auteur
- Florestan de Moor, Meven Mognol, Charles Deltel, Erwan Drezen, Julien Legriel, Dominique Lavenier
- article
- BIBM 2024 – IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, Dec 2024, Lisbonne, Portugal. pp.7176
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Synthetic Data: Generate Avatar Data on Demand
- auteur
- Thomas Lebrun, Louis Béziaud, Tristan Allard, Antoine Boutet, Sébastien Gambs, Mohamed Maouche
- article
- The International Web Information Systems Engineering conference (WISE), Dec 2024, Doha-Qatar, France. pp.193-203, ⟨10.1007/978-981-96-0576-7_15⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Towards space-efficient data structures for large genome-distance matrices with quick retrieval
- auteur
- Léo Ackermann, Pierre Peterlongo, Karel Břinda
- article
- SeqBim 2024 – Journées sur les Séquences en Bioinformatique, Informatique et. Mathématiques, Nov 2024, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Improve the resizing of the Backpack Quotient Filter
- auteur
- Nicolas Buchin, Victor Levallois, Pierre Peterlongo
- article
- SeqBim 2024 – Journées annuelles du groupe de travail SeqBIM (Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques), Nov 2024, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Masked superstrings as a compact, indexable and dynamic representation of k-mer sets
- auteur
- Ondřej Sladký, Pavel Veselý, Karel Břinda
- article
- SeqBim 2024 – Journées sur les Séquences en Bioinformatique, Informatique et. Mathématiques, Nov 2024, Rennes, France. pp.1-3
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Strategies to update a compacted de Bruijn graph
- auteur
- Khodor Hannoush, Camille Marchet, Pierre Peterlongo
- article
- SeqBIM 2024 – Journées annuelles du groupe de travail SeqBIM (Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques), Nov 2024, Rennes, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimized K-mer Matching For Million-Genome Collections On Laptops
- auteur
- Francesca Brunetti, Karel Břinda
- article
- SeqBIM 2024 – Journées sur les Séquences en Bioinformatique, Informatique et. Mathématiques,, Nov 2024, Rennes, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Primer design for DNA storage random access
- auteur
- Jeremy Mateos, Dominique Lavenier, Melpomeni Dimopoulou, Anthony Genot, Marc Antonini
- article
- CORESA 2024 – 23ème conférence sur COmpression et REprésentation des Signaux Audiovisuels, Nov 2024, Rennes, France. pp.1-3
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Assessing assembly quality in metagenomes of increasing complexity sequenced with HiFi long reads
- auteur
- Nicolas Maurice, Clémence Frioux, Claire Lemaitre, Riccardo Vicedomini
- article
- 2024 – 24th Genome Informatics meeting, Nov 2024, Hinxton, United Kingdom. pp.1-21
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- k-mer matrix compression
- auteur
- Alix Regnier, Pierre Peterlongo
- article
- SeqBIM 2024 – Journées annuelles du groupe de travail SeqBIM (Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques), Oct 2024, Rennes, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Uncovering communities of pipelines in the task-fMRI analytical space
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2024, Abu Dhabi, United Arab Emirates. ⟨10.1109/ICIP51287.2024.10647701⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Early prediction of the transferability of bovine embryos from videomicroscopy
- auteur
- Yasmine Hachani, Patrick Bouthemy, Elisa Fromont, Sylvie Ruffini, Ludivine Laffont, Alline de Paula Reis
- article
- ICIP 2024 – IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2024, Abu DHABI, United Arab Emirates. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- myCADI: my Contextual Anomaly Detection using Isolation
- auteur
- Véronne Yepmo, Grégory Smits
- article
- Proceedings of the 33rd ACM International Conference on Information and Knowledge Management (CIKM ’24), Oct 2024, Boise, ID, United States. ⟨10.1145/3627673.3679208⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- REFINE-LM: Mitigating Language Model Stereotypes via Reinforcement Learning
- auteur
- Mohammed Rameez Rameez Qureshi, Naïm Es-Sebbani, Luis Galárraga, Yvette Graham, Miguel Couceiro, Zied Bouraoui
- article
- ECAI 2024 – 27th European Conference on Artificial Intelligence, Oct 2024, Santiago de Compostela, Spain. pp.4027-4034, ⟨10.3233/FAIA240970⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Rapid Prediction of Genetic Relatedness of Escherichia coli Direct from Critical Care Samples Using Metagenomic Sequencing Paired with Neighbour Typing
- auteur
- Amanda Carroll, Leanne Mortimer, Hiren Ghosh, Sandra Reuter, Hajo Grundmann, Karel Brinda, William Hanage, Angel Li, Andrew Purssell, Bryan Coburn, Ashley Rooney, Shola Able-Thomas, Martin Antonio, Derek Macfadden, Allison Mcgeer
- article
- IDWeek 2024, Oct 2024, Los Angeles, CA, United States. pp.S357, ⟨10.1093/ofid/ofae631.598⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Database Approaches to the Modelling and Querying of Musical Scores: a Survey
- auteur
- Adel Aly, Olivier Pivert, Virginie Thion
- article
- Proceedings of the International Conference on Theory and Practice of Digital Libraries (TPDL’24), Sep 2024, Ljubljana, Slovenia
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pangenome graph manipulation for local visualisation with pancat
- auteur
- Siegfried Dubois, Matthias Zytnicki, Thomas Faraut, Claire Lemaitre
- article
- MIGGS1 2024 – 1st symposium on Methods for Interfacing with Graphs of Genomic Sequences, Sep 2024, Lille, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Categorial Dependency Grammars extended with barriers (CDGb) yield an Abstract Family of Languages (AFL)
- auteur
- Denis Béchet, Annie Foret
- article
- 5th International Conference on Natural Language Processing and Computational Linguistics (NLPCL 2024), David C. Wyld; Dhinaharan Nagamalai, Sep 2024, Copenhagen, Denmark. pp.53-66, ⟨10.5121/csit.2024.141706⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Theoretically Grounded Extension of Universal Attacks from the Attacker’s Viewpoint
- auteur
- Jordan Patracone, Paul Viallard, Emilie Morvant, Gilles Gasso, Amaury Habrard, Stéphane Canu
- article
- ECML PKDD 2024 – European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2024, Vilnius, Lithuania. pp.1-27, ⟨10.1007/978-3-031-70359-1_17⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparing Relational Concept Analysis and Graph-FCA on their Common Ground
- auteur
- Vanessa Fokou, Peggy Cellier, Xavier Dolques, Sébastien Ferré, Florence Le Ber
- article
- Concepts 2024 – International Joint Conference on Conceptual Knowledge Structures, Sep 2024, Cadiz, Spain. pp.1-16
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Precedability Prediction Between Open Educational Resources
- auteur
- Aymen Bazouzi, Hoël Le Capitaine, Zoltan Miklos, Mickaël Foursov
- article
- International Conference on Information Technology for Social Good (GoodIT ’24), Sep 2024, Bremen, Germany. ⟨10.1145/3677525.3678686⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automated Hierarchical Conflict Reduction for Crowdsourced Annotation Tasks using Belief Functions
- auteur
- Constance Thierry, David Gross-Amblard, Yolande Le Gall, Jean-Christophe Dubois
- article
- 8th International Conference on Belief Functions (BEFLIEF), Sep 2024, Belfast, United Kingdom
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A mean distance between elements of same class for rich labels
- auteur
- Arthur Hoarau, Constance Thierry, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- Belief Functions : Theory and Applications, 2024, Sep 2024, Belfast, United Kingdom
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Phenotypes Extraction from Text: Analysis and Perspective in the LLM Era
- auteur
- Moussa Baddour, Stéphane Paquelet, Paul Rollier, Marie De Tayrac, Olivier Dameron, Thomas Labbé
- article
- IS 2024 – 12th IEEE International Conference on Intelligent Systems, Aug 2024, Varna, Bulgaria. pp.1-8, ⟨10.1109/IS61756.2024.10705235⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cdbgtricks: Strategies to update a compacted de Bruijn graph
- auteur
- Khodor Hannoush, Camille Marchet, Pierre Peterlongo
- article
- PSC 2024 – Prague Stringology Conference, Faculty of Information Technology, Czech Technical University in Prague, Aug 2024, Prague (CZ), Czech Republic. pp.1-13, ⟨10.1101/2024.05.24.595676⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parallelization of the Banded Needleman & Wunsch Algorithm on UPMEM PiM Architecture for Long DNA Sequence Alignment
- auteur
- Meven Mognol, Dominique Lavenier, Julien Legriel
- article
- ICPP 2024 – International Conference on Parallel Processing, Aug 2024, Gotland, Sweden. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- WebAssembly serverless join: A Study of its Application
- auteur
- Chanattan Sok, Laurent d’Orazio, Reyyan Tekin, Dimitri Tombroff
- article
- International Conference on Scientific and Statistical Database Management (SSDBM), Jul 2024, Rennes France, France. pp.1-4, ⟨10.1145/3676288.3676305⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- VG-Prefetcher Cache: Towards Edge-Based Time Series Data Management Using Visibility Graph Prefetching
- auteur
- Akram Bensalem, Laurent d’Orazio, Julien Lallet, Andrea Enrici
- article
- International Conference on Scientific and Statistical Database Management (SSDBM), Jul 2024, Rennes France, France. pp.1-4, ⟨10.1145/3676288.3676304⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GUESS: monitorinG join qUery Execution in Serverless and Serverful spark
- auteur
- An-Truong Tran Phan, Laurent d’Orazio, Thuong-Cang Phan, Le Gruenwald
- article
- International Conference on Database Systems for Advanced Applications (DASFAA), Jul 2024, Gifu, Japan
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Prédiction précoce de la transférabilité d’embryons bovins par vidéomicroscopie
- auteur
- Yasmine Hachani, Patrick Bouthemy, Sylvie Ruffini, Ludivine Laffont, Elisa Fromont, Alline de Paula Reis
- article
- RFIAP 2024 – Congrès Reconnaissance des Formes, Image, Apprentissage et Perception, AFRIF (Association Française pour la Reconnaissance et l’Interprétation des Formes), Jul 2024, Lille, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Une borne PAC-Bayésienne sur une mesure de risque pour l’apprentissage équitable
- auteur
- Hind Atbir, Farah Cherfaoui, Guillaume Metzler, Emilie Morvant, Paul Viallard
- article
- CAP 2024 – Conférence sur l’Apprentissage Automatique, Jul 2024, Lille, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Form-based semantic caching on time series
- auteur
- Trung-Dung Le, Verena Kantere, Laurent d’Orazio
- article
- International Conference on Computational Science and Its Applications (ICCSA), Jul 2024, Hanoi (Vietnam), France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Fuzzy Logic-Based Approach to Semantic Query Answering with Missing Values
- auteur
- Fernando Bobillo, Carlos Bobed, Eduardo Mena, Umberto Straccia
- article
- 2024 IEEE International Conference on Fuzzy Systems (FUZZ-IEEE), Jun 2024, Yokohama, Japan. pp.1-8, ⟨10.1109/FUZZ-IEEE60900.2024.10611869⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Misconceptions about Galaxy debunked by the (French) Galaxy Community
- auteur
- Romane Libouban, Eva Mercier, Thomas Chaussepied, Bérénice Batut, Anthony Bretaudeau, Gildas Le Corguillé
- article
- JOBIM 2024 – Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jun 2024, TOULOUSE, France. pp.1-28
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Galaxy France: an example of a national UseGalaxy server
- auteur
- Clea Siguret, Thomas Chaussepied, Romane Libouban, Eva Mercier, Julien Seiler, Bérénice Batut, Gildas Le Corguillé, Anthony Bretaudeau
- article
- GCC 2024 – Galaxy Community Conference, Jun 2024, Brno, Czech Republic. pp.1-15, ⟨10.7490/f1000research.1119767.1⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- NPCS: Native Provenance Computation for SPARQL
- auteur
- Zubaria Asma, Daniel Hernández, Luis Galárraga, Giorgos Flouris, Irini Fundulaki, Katja Hose
- article
- WWW 2024 – ACM Web Conference, May 2024, Singapore, Singapore. pp.2085 – 2093, ⟨10.1145/3589334.3645557⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Query Optimization for Ontology-Mediated Query Answering
- auteur
- Wafaa El Husseini, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Hélène Jaudoin
- article
- The ACM Web Conference (WWW), May 2024, Singapore, Singapore. ⟨10.1145/3589334.3645567⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HeROcache: Storage-Aware Scheduling in Heterogeneous Serverless Edge – The Case of IDS
- auteur
- Vincent Lannurien, Camélia Slimani, Laurent d’Orazio, Olivier Barais, Stéphane Paquelet, Jalil Boukhobza
- article
- CCGrid 2024 – 24th IEEE/ACM international Symposium on Cluster, Cloud and Internet Computing, May 2024, Philadelphia, United States. pp.1-11
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Leveraging PAC-Bayes Theory and Gibbs Distributions for Generalization Bounds with Complexity Measures
- auteur
- Paul Viallard, Rémi Emonet, Amaury Habrard, Emilie Morvant, Valentina Zantedeschi
- article
- AISTATS 2024 – 27th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics, May 2024, Valencia, Spain
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- ConstrucTED : Constructing Tailored Educational Datasets From Online Courses
- auteur
- Aymen Bazouzi, Zoltan Miklos, Mickaël Foursov, Hoël Le Capitaine
- article
- 16th International Conference on Computer Supported Education (CSEDU), May 2024, Angers, France. pp.645-652, ⟨10.5220/0012745000003693⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Tackling the Abstraction and Reasoning Corpus (ARC) with Object-centric Models and the MDL Principle
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- IDA 2024 – Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2024, Stockholm, Sweden. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CADI: Contextual Anomaly Detection using an Isolation Forest
- auteur
- Véronne Yepmo, Grégory Smits, Marie-Jeanne Lesot, Olivier Pivert
- article
- The 39th ACM/SIGAPP Symposium On Applied Computing, Apr 2024, Avila, Spain. ⟨10.1145/3605098.3635969⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical model of phylogenetic compression
- auteur
- Veronika Hendrychová, Karel Břinda
- article
- DSB 2024 – Workshop Data Structures in Bioinformatics, Mar 2024, Montpellier, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards an edit distance between pangenome graphs
- auteur
- Siegfried Dubois, Zytnicki Matthias, Claire Lemaitre, Faraut Thomas
- article
- DSB 2024 – Workshop Data Structures in Bioinformatics, Mar 2024, Montpellier, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Fast and Accurate Context-Aware Basic Block Timing Prediction using Transformers
- auteur
- Abderaouf Nassim Amalou, Elisa Fromont, Isabelle Puaut
- article
- CC 2024 – ACM SIGPLAN 33rd International Conference on Compiler Construction, Gabriel Rodríguez, Mar 2024, Edimbourg, United Kingdom. pp.227-237, ⟨10.1145/3640537.3641572⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CEGAR-Based Approach for Solving Combinatorial Optimization Modulo Quantified Linear Arithmetics Problems
- auteur
- Kerian Thuillier, Anne Siegel, Loïc Paulevé
- article
- AAAI 2024 – The 38th Annual AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2024, Vancouver, Canada. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Shaping Up SHAP: Enhancing Stability through Layer-Wise Neighbor Selection
- auteur
- Gwladys Kelodjou, Laurence Rozé, Véronique Masson, Luis Galárraga, Romaric Gaudel, Maurice Tchuente, Alexandre Termier
- article
- AAAI 2024 – 38th Annual AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2024, Vancouver, Canada. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Assembling close strains in metagenome assemblies using discrete optimization
- auteur
- Tam Khac Minh Truong, Roland Faure, Rumen Andonov
- article
- BIOINFORMATICS 2024 – 15th International conference on bioinformatics models, methods and algorithms, Feb 2024, Rome, Italy. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Understanding the limits of pangenome graphs for the analysis of large inversions in a complex of butterfly species
- auteur
- Sandra Romain, Fabrice Legeai, Claire Lemaitre
- article
- 2024 – International Environmental and Agronomical Genomics symposium, Feb 2024, Toulouse, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ICT within limits compared with fisheries within limits
- auteur
- Olivier Ridoux
- article
- Undone Computer Science, Université de Nantes, Inria, and LORIA Université de Lorraine, Feb 2024, Nantes (France), France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Méthode crédibiliste pour l’extraction d’incertitudes sans dépendance aux observations
- auteur
- Arthur Hoarau, Vincent Lemaire, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- EGC 2024 – 24ème conférence francophone sur l’Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2024, Dijon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Investigating the use of language models for natural language querying over knowledge graphs
- auteur
- Alexandra Épiphanie Padonou, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- EGC 2024 – 24ème conférence francophone sur l’Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2024, Dijon, France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Book sections
- titre
- Neurosymbolic Methods for Rule Mining
- auteur
- Agnieszka Ławrynowicz, Luis Galárraga, Mehwish Alam, Bérénice Jaulmes, Václav Zeman, Tomas Kliegr
- article
- Handbook on Neurosymbolic Artificial Intelligence, In press
- typdoc
- Book sections
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Food and Functionalities
- auteur
- Emeline Roux
- article
- Life Sciences [q-bio]. Université de Rennes, 2024
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Books
- titre
- Cabbage and turnip: rediscovering old friends
- auteur
- Houria Hadj-Arab, Aicha Blama, Anne-Marie Chèvre, Matéo Boudet, Lydia Bousset, Loïc Daniel, Cyril Falentin, Pascal Glory, Marie-Hélène Wagner, Audrey Dupont, Anna Geraci, Elisabetta Oddo, Rosario Schicchi, Valeria Terzi, Lovro Sinkovic, Vladimir Meglič, Barbara Pipan
- article
- pp.1-192, 2024, ⟨10.57745/YD4VHS⟩
- typdoc
- Books
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Advances in Knowledge Discovery and Management
- auteur
- Rakia Jaziri, Arnaud Martin, Antoine Cornuéjols, Etienne Cuvelier, Fabrice Guillet
- article
- Springer Nature Switzerland, 1110, 2024, Studies in Computational Intelligence, 9783031404023. ⟨10.1007/978-3-031-40403-0⟩
- typdoc
- Books
- Accès au bibtex
-
Theses
- titre
- Dynamic Pan-genome Graphs
- auteur
- Khodor Hannoush
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Univ Rennes, Inria, CNRS, IRISA, France, 2024. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Machine learning algorithms in the health sector : integration of functional knowledge toenhance the analysis of gut microbiota data
- auteur
- Baptiste Ruiz
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2024. English. ⟨NNT : 2024URENS050⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Haplotype assembly from long reads
- auteur
- Roland Faure
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes; Université libre de Bruxelles, 2024. English. ⟨NNT : 2024URENS052⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Numerical rule mining for the prediction of plant disease dynamics.
- auteur
- Olivier Gauriau
- article
- Apprentissage [cs.LG]. Université de Rennes, 2024. Français. ⟨NNT : 2024URENS036⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Identification, genotyping and representation of structural variants in pangenomes
- auteur
- Sandra Romain
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2024. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Hybrid satisfiability methods for the inference of boolean regulations controlling metabolic networks
- auteur
- Kerian Thuillier
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2024. English. ⟨NNT : 2024URENS032⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Active Learning of Uncertain and Imprecise Data
- auteur
- Arthur Hoarau
- article
- Apprentissage [cs.LG]. Université de Rennes, 2024. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
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-
2023
Journal articles
- titre
- decOM: similarity-based microbial source tracking of ancient oral samples using k-mer-based methods
- auteur
- Camila Duitama González, Riccardo Vicedomini, Téo Lemane, Nicolas Rascovan, Hugues Richard, Rayan Chikhi
- article
- Microbiome, 2023, 11 (1), pp.1-12. ⟨10.1186/s40168-023-01670-3⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- aKmerBroom: Ancient oral DNA decontamination using Bloom filters on k-mer sets
- auteur
- Camila Duitama González, Samarth Rangavittal, Riccardo Vicedomini, Rayan Chikhi, Hugues Richard
- article
- iScience, 2023, 26 (11), pp.108057. ⟨10.1016/j.isci.2023.108057⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Deep mutational scanning reveals the molecular determinants of RNA polymerase-mediated adaptation and tradeoffs
- auteur
- Alaksh Choudhury, Benoit Gachet, Zoya Dixit, Roland Faure, Ryan Gill, Olivier Tenaillon
- article
- Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.6319. ⟨10.1038/s41467-023-41882-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Predicting enzymatic function of protein sequences with attention
- auteur
- Nicolas Buton, François Coste, Yann Le Cunff
- article
- Bioinformatics, 2023, 39 (10), pp.1-10. ⟨10.1093/bioinformatics/btad620⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Concepts of Neighbors and their Application to Instance-based Learning on Relational Data
- auteur
- H. Ambre Ayats, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- International Journal of Approximate Reasoning, 2023, 164, pp.1-49. ⟨10.1016/j.ijar.2023.109059⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- RTGEN++: A Relative Temporal Graph GENerator
- auteur
- Maria Massri, Zoltan Miklos, Philippe Raipin, Pierre Meye, Amaury Bouchra Pilet, Thomas Hassan
- article
- Future Generation Computer Systems, In press, 146, pp.139-155. ⟨10.1016/j.future.2023.03.023⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Phylogenetic inference of the emergence of sequence modules and protein-protein interactions in the ADAMTS-TSL family
- auteur
- Olivier Dennler, François Coste, Samuel Blanquart, Catherine Belleannée, Nathalie Théret
- article
- PLoS Computational Biology, 2023, 19 (8), pp.e1011404. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011404⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sky-signatures: detecting and characterizing recurrent behavior in sequential data
- auteur
- Clément Gautrais, Peggy Cellier, Thomas Guyet, René Quiniou, Alexandre Termier
- article
- Data Mining and Knowledge Discovery, 2023, ⟨10.1007/s10618-023-00949-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- MTG-Link: leveraging barcode information from linked-reads to assemble specific loci
- auteur
- Anne Guichard, Fabrice Legeai, Denis Tagu, Claire Lemaitre
- article
- BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.284. ⟨10.1186/s12859-023-05395-w⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- SVJedi-graph: improving the genotyping of close and overlapping structural variants with long reads using a variation graph
- auteur
- Sandra Romain, Claire Lemaitre
- article
- Bioinformatics, 2023, 39 (Supplement_1), pp.270 – 278. ⟨10.1093/bioinformatics/btad237⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic genome-based metabolic modeling of the predominant cellulolytic rumen bacterium Fibrobacter succinogenes S85
- auteur
- Ibrahim Fakih, Jeanne Got, Carlos Eduardo Robles-Rodriguez, Anne Siegel, Evelyne Forano, Rafael Munoz Tamayo
- article
- mSystems, 2023, 8 (3), pp.1-23. ⟨10.1128/msystems.01027-22⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Evidential Random Forests
- auteur
- Arthur Hoarau, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- Expert Systems with Applications, 2023, 230, pp.120652. ⟨10.1016/j.eswa.2023.120652⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Inferring and comparing metabolism across heterogeneous sets of annotated genomes using AuCoMe
- auteur
- Arnaud Belcour, Jeanne Got, Méziane Aite, Ludovic Delage, Jonas Collén, Clémence Frioux, Catherine Leblanc, Simon M Dittami, Samuel Blanquart, Gabriel V. Markov, Anne Siegel
- article
- Genome Research, 2023, 33, pp.972 – 987. ⟨10.1101/gr.277056.122⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the benefits of self-taught learning for brain decoding
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- GigaScience, 2023, 12, pp.1-17. ⟨10.1093/gigascience/giad029⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- fimpera: drastic improvement of Approximate Membership Query data-structures with counts
- auteur
- Lucas Robidou, Pierre Peterlongo
- article
- Bioinformatics, 2023, 39 (5), pp.1-16. ⟨10.1101/2022.06.27.497694⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- First chromosome scale genomes of ithomiine butterflies (Nymphalidae: Ithomiini): comparative models for mimicry genetic studies
- auteur
- Jérémy Gauthier, Joana Meier, Fabrice Legeai, Melanie McClure, Annabel Whibley, Anthony Bretaudeau, Hélène Boulain, Hugues Parrinello, Sam T. Mugford, Richard Durbin, Chenxi Zhou, Shane McCarthy, Christopher W. Wheat, Florence Piron-Prunier, Christelle Monsempes, Marie‐Christine François, Paul Jay, Camille Noûs, Emma Persyn, Emmanuelle Jacquin-Joly, Camille Meslin, Nicolas Montagné, Marianne Elias, Claire Lemaitre
- article
- Molecular Ecology Resources, In press, 23 (4), pp.872-885. ⟨10.1111/1755-0998.13749⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HaploBlocks: Efficient Detection of Positive Selection in Large Population Genomic Datasets
- auteur
- Benedikt Kirsch-Gerweck, Leonard Bohnenkämper, Michel T Henrichs, Jarno N Alanko, Hideo Bannai, Bastien Cazaux, Pierre Peterlongo, Joachim Burger, Jens Stoye, Yoan Diekmann
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2023, 40 (3), pp.1-12. ⟨10.1093/molbev/msad027⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Stocker les données : la piste prometteuse de l’ADN
- auteur
- Dominique Lavenier, Marc Antonini, Yannick Rondelez, A.J. Genot
- article
- Interstices, 2023
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Estimation of the qualification and behavior of a contributor and aggregation of his answers in a crowdsourcing context
- auteur
- Constance Thierry, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- Expert Systems with Applications, 2023
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Galaxy Training: A powerful framework for teaching!
- auteur
- Saskia Hiltemann, Helena Rasche, Simon Gladman, Hans-Rudolf Hotz, Delphine Larivière, Daniel Blankenberg, Pratik Jagtap, Thomas Wollmann, Anthony Bretaudeau, Nadia Goué, Timothy Griffin, Coline Royaux, Yvan Le Bras, Subina Mehta, Anna Syme, Frederik Coppens, Bert Droesbeke, Nicola Soranzo, Wendi Bacon, Fotis Psomopoulos, Cristóbal Gallardo-Alba, John Davis, Melanie Christine Föll, Matthias Fahrner, Maria Doyle, Beatriz Serrano-Solano, Anne Claire Fouilloux, Peter van Heusden, Wolfgang Maier, Dave Clements, Florian Heyl, Björn Grüning, Bérénice Batut
- article
- PLoS Computational Biology, 2023, 19 (1), pp.e1010752. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010752⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fixing molecular complexes in BioPAX standards to enrich interactions and detect redundancies using Semantic Web Technologies
- auteur
- Camille Juigné, Olivier Dameron, François Moreews, Florence Gondret, Emmanuelle Becker
- article
- Bioinformatics, 2023, 39 (5), pp.btad257. ⟨10.1093/bioinformatics/btad257⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Insights into the potential for mutualistic and harmful host‐microbe interactions affecting brown alga freshwater acclimation
- auteur
- Hetty Kleinjan, Clémence Frioux, Gianmaria Califano, Méziane Aite, Enora Fremy, Elham Karimi, Erwan Corre, Thomas Wichard, Anne Siegel, Catherine Boyen, Simon M. Dittami
- article
- Molecular Ecology, In press, 32 (3), pp.703-723. ⟨10.1111/mec.16766⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- BayesTICS: Local temporal image correlation spectroscopy and Bayesian simulation technique for sparse estimation of diffusion in fluorescence imaging
- auteur
- Anca Caranfil, Yann Le Cunff, Charles Kervrann
- article
- Biological Imaging, 2023, Biological Imaging, 3, pp.1-12. ⟨10.1017/s2633903x23000041⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A dataset to study group-housed sows’ individual behaviours and production responses to different short-term events
- auteur
- Maëva Durand, Christine Largouët, Louis Bonneau de Beaufort, Jean-Yves Dourmad, Charlotte Gaillard
- article
- Animal – Open Space, 2023, 2, pp.100039. ⟨10.1016/j.anopes.2023.100039⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Prediction of the daily nutrient requirements of gestating sows based on sensor data and machine-learning algorithms
- auteur
- Maëva Durand, Christine Largouët, Louis Bonneau de Beaufort, Jean-Yves Dourmad, Charlotte Gaillard
- article
- Journal of Animal Science, 2023, 101, pp.skad337. ⟨10.1093/jas/skad337⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Estimation of gestating sows’ welfare status based on machine learning methods and behavioral data
- auteur
- Maëva Durand, Christine Largouët, Louis Bonneau de Beaufort, Jean-Yves Dourmad, Charlotte Gaillard
- article
- Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.21042. ⟨10.1038/s41598-023-46925-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Small networks of expressed genes in the whole blood and relationships to profiles in circulating metabolites provide insights in inter-individual variability of feed efficiency in growing pigs
- auteur
- Camille Juigné, Emmanuelle Becker, Florence Gondret
- article
- BMC Genomics, 2023, 23, pp.1-20. ⟨10.1186/s12864-023-09751-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- Mapping-friendly Sequence Reductions to process compressed genomic data
- auteur
- Roland Faure, Baptiste Hilaire, Dominique Lavenier
- article
- SeqBIM 2023, Nov 2023, Lille, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards an edit distance between pangenome graphs
- auteur
- Siegfried Dubois, Benjamin Linard, Matthias Zytnicki, Claire Lemaitre, Thomas Faraut
- article
- SeqBIM 2023 – Journées sur les Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques, Nov 2023, Lille, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Mathematical model of phylogenetic compression
- auteur
- Veronika Hendrychová, Karel Břinda
- article
- SeqBIM 2023 – journées annuelles Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques, Nov 2023, Lille, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The Need for Better RDF Archiving Benchmarks
- auteur
- Olivier Pelgrin, Ruben Taelman, Luis Galárraga, Katja Hose
- article
- MEPDaW 2023 – Managing the Evolution and Preservation of the Data Web, Nov 2023, Athens, Greece. pp.1-5
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Language Models as Controlled Natural Language Semantic Parsers for Knowledge Graph Question Answering
- auteur
- Jens Lehmann, Preetam Gattogi, Dhananjay Bhandiwad, Sébastien Ferré, Sahar Vahdati
- article
- ECAI 2023 – 26th European Conference on Artificial Intelligence, Sep 2023, Krakow (Cracovie), Poland. pp.1348–1356, ⟨10.3233/FAIA230411⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- OneWater FAIR Data Platform : setting up a national FAIR water data platform and community
- auteur
- Sylvain Grellet, Isabelle Braud, Fanny Arnaud, Kenneth Maussang, Anne Laurent, Frédéric Huynh, Hervé Piégay, Lise Vaudor, Christelle Pierkot, Sandrine Charles, Yvan Le Bras, Laurent Longuevergne, Hervé Squividant, Mario Adam, Charly Coussot, Véronique Chaffard
- article
- TERENO OZCAR 2023 – 2ème conférence internationale TERENO OZCAR, TERENO and OZCAR networks, Sep 2023, Bonn, Germany. pp.1-23
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extracting ODRL Digital Right Representations from License Texts using AMR
- auteur
- Malo Revel, Aurélien Lamercerie, Annie Foret, Zoltan Miklos
- article
- ASAIL 2023 – Automated Semantic Analysis of Information in Legal Text, Sep 2023, Braga, Portugal. pp.1-7
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interactive Visualization of Counterfactual Explanations for Tabular Data
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML/PKDD 2023 – European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2023, Turin, Italy. pp.330-334, ⟨10.1007/978-3-031-43430-3_25⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Generating robust counterfactual explanations
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML/PKDD – European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2023, Turin (Italie), Italy. pp.1-16
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling evolutionary responses in crowdsourcing MCQ using belief function theory
- auteur
- Constance Thierry, Arnaud Martin, Yolande Le Gall, Jean-Christophe Dubois
- article
- 27th International Conference on Knowledge-Based and Intelligent Information & Engineering Systems (KES 2023), Sep 2023, Athens, Greece
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic sliding window encoding for data storageon DNA under biological and indexing constraints
- auteur
- Chloé Berton, Gouenou Coatrieux, Dominique Lavenier, Haddad S.
- article
- EUSIPCO 2023: 31st European Signal Processing Conference, Sep 2023, Helsiinki, Finland. pp.1-5, ⟨10.23919/EUSIPCO58844.2023.10289957⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dexteris: Data Exploration and Transformation with a Guided Query Builder Approach
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- DEXA 2023 – 34th International Conference on Database and Expert Systems Applications, Aug 2023, Penang, Malaysia, Malaysia. pp.361-376, ⟨10.1007/978-3-031-39847-6_29⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Combined transcriptomics and metabolomics in the whole blood to depict feed efficiency in pigs
- auteur
- Camille Juigné, Emmanuelle Becker, Florence Gondret
- article
- 74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.516
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Precise Segmentation for Children Handwriting Analysis by Combining Multiple Deep Models with Online Knowledge
- auteur
- Simon Corbillé, Eric Anquetil, Elisa Fromont
- article
- ICDAR 2023 – 17th International Conference on Document Analysis and Recognition, Aug 2023, San José, United States. pp.1-18
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Datasets with rich Labels for Machine Learning
- auteur
- Arthur Hoarau, Constance Thierry, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- 2023 IEEE International Conference on Fuzzy Systems (FUZZ), Aug 2023, Incheon, France. ⟨10.1109/FUZZ52849.2023.10309672⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Scalable Computation of Fuzzy Joins Over Large Collections of JSON Data
- auteur
- Remi Uhartegaray, Laurent d’Orazio, Matthew Damigos, Eleftherios Kalogeros
- article
- 2023 IEEE International Conference on Fuzzy Systems (FUZZ), Aug 2023, Incheon, South Korea. ⟨10.1109/fuzz52849.2023.10309759⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- PyClause -Simple and Efficient Rule Handling for Knowledge Graphs
- auteur
- Patrick Betz, Luis Galárraga, Simon Ott, Christian Meilicke, Fabian Suchanek, Heiner Stuckenschmidt
- article
- Thirty-Third International Joint Conference on Artificial Intelligence {33 IJCAI-24}, Aug 2023, Jeju, South Korea. pp.8610-8613, ⟨10.24963/ijcai.2024/991⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Graph-FCA Meets Pattern Structures
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- ICFCA 2023 – 17th International Conference on Formal Concept Analysis, Jul 2023, Kassel, Germany. pp.33-48, ⟨10.1007/978-3-031-35949-1_3⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CAWET: Context-Aware Worst-Case Execution Time Estimation Using Transformers
- auteur
- Abderaouf N Amalou, Elisa Fromont, Isabelle Puaut
- article
- ECRTS 2023 – 35th Euromicro Conference on Real-Time Systems, Jul 2023, Vienne, Austria. pp.7:1–7:20, ⟨10.4230/LIPIcs.ECRTS.2023.7⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- OHBM 2023 – 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montreal, Canada
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HairSplitter: separating strains in metagenome assemblies with long reads
- auteur
- Roland Faure, Jean-François Flot, Dominique Lavenier
- article
- JOBIM 2023 – Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2023, Plouzané, France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Compressed Indexing for Consecutive Occurrences
- auteur
- Paweł Gawrychowski, Garance Gourdel, Tatiana Starikovskaya, Teresa Anna Steiner
- article
- CPM 2023 – 34th Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, Jun 2023, Paris, France. ⟨10.4230/LIPIcs.CPM.2023.12⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Regularization, Semi-supervision, and Supervision for a Plausible Attention-Based Explanation
- auteur
- Duc Hau Nguyen, Cyrielle Mallart, Guillaume Gravier, Pascale Sébillot
- article
- 28th International Conference on Natural Language and Information Systems (NLDB), Jun 2023, Derby, United Kingdom. pp.285-298
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Honey, Tell Me What’s Wrong », Explicabilité Globale des Modèles de TAL par la Génération Coopérative
- auteur
- Antoine Chaffin, Julien Delaunay
- article
- CORIA TALN RJCRI RECITAL 2023 – 18e Conférence en Recherche d’Information et Applications \ 16e Rencontres Jeunes Chercheurs en RI \ 30e Conférence sur le Traitement Automatique des Langues Naturelles \ 25e Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues, Jun 2023, Paris, France. pp.105-122
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analytics for Language Learning : Transmettre aux enseignants les profils linguistiques de leurs apprenants
- auteur
- Thomas Gaillat, Cyrielle Mallart, Anatole Faugère, Andrew Simpkin, Bernardo Stearns, Paula Lissón, Jen-Yu Li, Nicolas Ballier, Rémi Venant
- article
- Atelier GERAS @ 62e Congrès annuel de la SAES 2023, Université Rennes 2; SAES La Sorbonne Nouvelle; GERAS (Groupe d’Etude et de Recherche en Anglais de Spécialité), Jun 2023, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Improved Complexity Results and an Efficient Solution for Connected Multi-Agent Path Finding
- auteur
- Isseïnie Calviac, Ocan Sankur, François Schwarzentruber
- article
- AAMAS 2023 – 22nd International Conference on Autonomous Agents and Multiagent Systems, May 2023, London, United Kingdom. pp.1-9
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep metric learning for visual servoing: when pose and image meet in latent space
- auteur
- Samuel Felton, Élisa Fromont, Eric Marchand
- article
- ICRA 2023 – IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2023, London, United Kingdom. pp.741-747, ⟨10.1109/ICRA48891.2023.10160963⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GLENDA: Querying over RDF Archives with SPARQL
- auteur
- Olivier Pelgrin, Ruben Taelman, Luis Galárraga, Katja Hose
- article
- ESWC 2023 – 20th International Conference on The Semantic Web, May 2023, Hersonisos, Crete, Greece. pp.75-80, ⟨10.1007/978-3-031-43458-7_14⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HeROfake: Heterogeneous Resources Orchestration in a Serverless Cloud – An Application to Deepfake Detection
- auteur
- Vincent Lannurien, Laurent d’Orazio, Olivier Barais, Esther Bernard, Olivier Weppe, Laurent Beaulieu, Amine Kacete, Stéphane Paquelet, Jalil Boukhobza
- article
- CCGrid 2023 – IEEE/ACM 23rd International Symposium on Cluster, Cloud and Internet Computing, May 2023, Bangalore, India. pp.154-165, ⟨10.1109/CCGrid57682.2023.00024⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- OptiRef: Query Optimization for Knowledge Bases
- auteur
- Wafaa El Husseini, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Hélène Jaudoin
- article
- The ACM Web Conference (WWW), Apr 2023, Austin, United States. ⟨10.1145/3543873.3587342⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Visualizing How-Provenance Explanations for SPARQL Queries
- auteur
- Luis Galárraga, Daniel Hernández, Anas Katim, Katja Hose
- article
- WWW 2023 – ACM International World Wide Web Conference, Apr 2023, Austin, United States. pp.212-216, ⟨10.1145/3543873.3587350⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Adaptation of AI Explanations to Users’ Roles
- auteur
- Julien Delaunay, Christine Largouët, Luis Galárraga, Niels Van Berkel
- article
- HCXAI 2023 – Workshop on Human-Centered Explainable AI, Apr 2023, Hamburg, Germany. pp.1-7
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Impressions and Strategies of Academic Advisors When Using a Grade Prediction Tool During Term Planning
- auteur
- Gonzalo Gabriel Méndez, Luis Galárraga, Katherine Chiluiza, Patricio Mendoza
- article
- CHI 2023 – Conference on Human Factors in Computing Systems, Apr 2023, Hamburg, Germany. pp.1-18, ⟨10.1145/3544548.3581575⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- EMBEDD-ER : EMBEDDing Educational Resources Using Linked Open Data
- auteur
- Aymen Bazouzi, Mickaël Foursov, Hoël Le Capitaine, Zoltan Miklos
- article
- 15th International Conference on Computer Supported Education (CSEDU), Apr 2023, Prague, Czech Republic. pp.439-446, ⟨10.5220/0012045300003470⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Grammatical profiling with UD annotation (WiP)
- auteur
- Nicolas Ballier, Cyrielle Mallart, Thomas Gaillat
- article
- Workshop on Profiling second language vocabulary and grammar, University of Gothenburg, Humanisten., Apr 2023, Gothenburg, Sweden
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Effects of Locality and Rule Language on Explanations for Knowledge Graph Embeddings
- auteur
- Luis Galárraga
- article
- IDA 2023 – Advances in Intelligent Data Analysis XXI, Apr 2023, Louvain-la-Neuve, Belgium. pp.143-155, ⟨10.1007/978-3-031-30047-9_12⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Representation learning for more reproducible fMRI data analyses
- auteur
- Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
- article
- IABM 2023 – Colloque Français d’Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical, Mar 2023, Paris, France. pp.1
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Persistence-Based Discretization for Learning Discrete Event Systems from Time Series
- auteur
- Lénaïg Cornanguer, Christine Largouët, Laurence Rozé, Alexandre Termier
- article
- MLmDS 2023 – AAAI Workshop When Machine Learning meets Dynamical Systems: Theory and Applications, Feb 2023, Washington (DC), United States. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Scaling Large RDF Archives To Very Long Histories
- auteur
- Olivier Pelgrin, Ruben Taelman, Luis Galárraga, Katja Hose
- article
- ICSC 2023 – IEEE 17th International Conference on Semantic Computing, Feb 2023, Laguna Hills, United States. pp.41-48, ⟨10.1109/ICSC56153.2023.00013⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Optimal Square Detection Over General Alphabets
- auteur
- Jonas Ellert, Paweł Gawrychowski, Garance Gourdel
- article
- SODA – 2023 Annual ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms, Jan 2023, Florence, Italy. pp.5220-5242, ⟨10.1137/1.9781611977554.ch189⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Visualiser des explications contrefactuelles pour des données tabulaires
- auteur
- Victor Guyomard, François Wallyn, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- EGC 2023 – Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2023, Lyon, France. pp.557-564
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Le principe MDL au service de l’automatisation de tâches uniques d’abstraction et de raisonnement (ARC) à partir de peu d’exemples
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- EGC 2023 – Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2023, Lyon, France. pp.235-246
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- From Structured Textual Data to Semantic Linked-data for Georgian Verbal Knowledge
- auteur
- Archil Elizbarashvili, Mireille Ducassé, Manana Khachidze, Magda Tsintsadze
- article
- ELEX 2023: ELECTRONIC LEXICOGRAPHY IN THE 21ST CENTURY, 2023, Brno, Czech Republic
- typdoc
- Conference papers
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-
Book sections
- titre
- Clock-G: Temporal Graph Management System
- auteur
- Maria Massri, Zoltan Miklos, Philippe Raipin, Pierre Meye
- article
- Lecture Notes in Computer Science, 14160 (LIV), Springer, pp.1-40, In press, Transactions on Large-Scale Data- and Knowledge-Centered Systems, ⟨10.1007/978-3-662-68014-8_1⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Métagénomique et métatranscriptomique
- auteur
- Cervin Guyomar, Claire Lemaitre
- article
- Des séquences aux graphes. Méthodes et structures discrètes pour la bioinformatique, ISTE, pp.1-36, 2023, 9781789480665
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Serverless Cloud Computing: State of the Art and Challenges
- auteur
- Vincent Lannurien, Laurent D’orazio, Olivier Barais, Jalil Boukhobza
- article
- Serverless Computing: Principles and Paradigms, 162, Springer International Publishing, pp.275-316, 2023, Lecture Notes on Data Engineering and Communications Technologies, ⟨10.1007/978-3-031-26633-1_11⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Data Mining‐Based Techniques for Software Fault Localization
- auteur
- Peggy Cellier, Mireille Ducassé, Sébastien Ferré, Olivier Ridoux, W. Eric Wong
- article
- Handbook of Software Fault Localization, 1, Wiley, Chapitre 7, 2023, 9781119291824. ⟨10.1002/9781119880929.ch7⟩
- typdoc
- Book sections
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-
Theses
- titre
- DNA fragment assembly: graph structures and chloroplast genome scaffolding
- auteur
- Victor Epain
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS083⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Efficient ontology-based data management
- auteur
- Wafaa El Husseini
- article
- Databases [cs.DB]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS102⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Kappa language modelling of hepatic star cell dynamics during fibrosis development and reversion
- auteur
- Matthieu Bouguéon
- article
- Médecine humaine et pathologie. Université de Rennes, 2023. Français. ⟨NNT : 2023URENB073⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Knowledge graph construction from texts with an explainable, human-centered Artificial Intelligence
- auteur
- H. Ambre Ayats
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS095⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Explainability for machine learning models : from data adaptability to user perception
- auteur
- Julien Delaunay
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS076⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Machine learning for timing estimation
- auteur
- Abderaouf Nassim Amalou
- article
- Other [cs.OH]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS087⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integration and analysis of heterogeneous biological data through multilayer graph exploitation to gain deeper insights into feed efficiency variations in growing pigs
- auteur
- Camille Juigné
- article
- Agricultural sciences. Institut national d’enseignement supérieur pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement, 2023. English. ⟨NNT : 2023AGROC170⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Explainable job recommender systems for recruiters and consulting companies
- auteur
- François Mentec
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS086⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Explainable Job Recommender Systems for Recruiters and Consulting Companies
- auteur
- François Mentec
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DNA fragment assembly, graph structures and chloroplast genome scaffolding : comparative analyses, formulations and implementations
- auteur
- Victor Epain
- article
- Other [cs.OH]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS083⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Timed automata learning from time series
- auteur
- Lénaïg Cornanguer
- article
- Automatic Control Engineering. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS051⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sketch-based approaches to process massive string data
- auteur
- Garance Gourdel
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS049⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Modèle Transformer pour l’interprétabilité et les prédictions multi-niveaux des fonctions des protéines à partir de leurs séquences
- auteur
- Nicolas Buton
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS040⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Search engine for genomic sequencing data
- auteur
- Lucas Robidou
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS039⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Privacy risk analysis of large-scale temporal data : application to electricity consumption data
- auteur
- Antonin Voyez, Antonin Voyez
- article
- Other [cs.OH]. Université de Rennes, 2023. English. ⟨NNT : 2023URENS023⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Integrating Explicit Knowledge with Deep Learning for Children’s Handwriting Recognition and Segmentation
- auteur
- Simon Corbillé
- article
- Apprentissage [cs.LG]. Université de Rennes, 2023. Français. ⟨NNT : 2023URENS021⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Improving Image Quality using High Dynamic Range and Aesthetics Assessment
- auteur
- Mathieu Chambe
- article
- Image Processing [eess.IV]. Univ Rennes, 2023. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Journal articles
- titre
- Reasoning over Time into Models with DataTime
- auteur
- Gauthier Lyan, Jean-Marc Jézéquel, David Gross-Amblard, Romain Lefeuvre, Benoit Combemale
- article
- Software and Systems Modeling, 2022, pp.1-25
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- kmdiff, large-scale and user-friendly differential k-mer analyses
- auteur
- Téo Lemane, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- Bioinformatics, 2022, 38 (24), pp.5443-5445. ⟨10.1093/bioinformatics/btac689⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- The evolutionary process of invasion in the fall armyworm (Spodoptera frugiperda)
- auteur
- Sudeeptha Yainna, Wee Tek Tay, Karine Durand, Estelle Fiteni, Frédérique Hilliou, Fabrice Legeai, Anne-Laure Clamens, Sylvie Gimenez, R. Asokan, C. M. Kalleshwaraswamy, Sharanabasappa S. Deshmukh, Robert L. Meagher Jr., Carlos A. Blanco, Pierre J. Silvie, Thierry Brévault, Anicet Dassou, Gael Kergoat, Thomas Walsh, Karl Gordon, Nicolas Nègre, Emmanuelle d’Alençon, Kiwoong Nam
- article
- Scientific Reports, 2022, 12, pp.21063. ⟨10.1038/s41598-022-25529-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidential prototype-based clustering based on transfer learning
- auteur
- Kuang Zhou, Mei Guo, Arnaud Martin
- article
- International Journal of Approximate Reasoning, 2022, 151, pp.322-343. ⟨10.1016/j.ijar.2022.10.001⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving reusability along the data life cycle: a Regulatory Circuits Case Study
- auteur
- Marine Louarn, Fabrice Chatonnet, Xavier Garnier, Thierry Fest, Anne Siegel, Catherine Faron, Olivier Dameron
- article
- Journal of Biomedical Semantics, 2022, 13 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/s13326-022-00266-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Gut microbiota analysis for prediction of clinical relapse in Crohn’s disease
- auteur
- Sylvie Buffet-Bataillon, Guillaume Bouguen, François Fleury, Vincent Cattoir, Yann Le Cunff
- article
- Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.19929. ⟨10.1038/s41598-022-23757-x⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Host-plant adaptation as a driver of incipient speciation in the fall armyworm ( Spodoptera frugiperda )
- auteur
- Estelle Fiteni, Karine Durand, Sylvie Gimenez, Robert L. Meagher Jr., Robert L Meagher Jr., Fabrice Legeai, Gael J. Kergoat, Nicolas Nègre, Emmanuelle dAlençon, Ki Woong Nam
- article
- BMC Ecology and Evolution, 2022, 22, pp.133. ⟨10.1186/s12862-022-02090-x⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Combination of explicit segmentation with Seq2Seq recognition for fine analysis of children handwriting
- auteur
- Omar Krichen, Simon Corbillé, Eric Anquetil, Nathalie Girard, Elisa Fromont, Pauline Nerdeux
- article
- International Journal on Document Analysis and Recognition, 2022, ⟨10.1007/s10032-022-00409-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A New Belief-based Incomplete Pattern Unsupervised Classification Method
- auteur
- Zuowei Zhang, Zhe Liu, Zongfang Ma, Yiru Zhang, Hao Wang
- article
- IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, 2022, 34 (11), pp.5084-5097. ⟨10.1109/TKDE.2021.3049511⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- QuickDeconvolution: fast and scalable deconvolution of linked-read sequencing data
- auteur
- Roland Faure, Dominique Lavenier
- article
- Bioinformatics Advances, 2022, pp.1-8. ⟨10.1093/bioadv/vbac068/6717790⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The K-mer File Format: a standardized and compact disk representation of sets of k-mers
- auteur
- Yoann Dufresne, Teo Lemane, Pierre Marijon, Pierre Peterlongo, Amatur Rahman, Marek Kokot, Paul Medvedev, Sebastian Deorowicz, Rayan Chikhi
- article
- Bioinformatics, 2022, 38 (18), pp.4423-4425. ⟨10.1093/bioinformatics/btac528⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Rumen microbial genomics: from cells to genes (and back to cells)
- auteur
- Milka Popova, Ibrahim Fakih, Evelyne Forano, Anne Siegel, Rafael Muñoz-Tamayo, Diego Morgavi
- article
- CAB Reviews Perspectives in Agriculture Veterinary Science Nutrition and Natural Resources, 2022, 2022, ⟨10.1079/cabireviews202217025⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genomic evidence for global ocean plankton biogeography shaped by large-scale current systems
- auteur
- Daniel Richter, Romain Watteaux, Thomas Vannier, Jade Leconte, Paul Frémont, Gabriel Reygondeau, Nicolas Maillet, Nicolas Henry, Gaëtan Benoit, Antonio Fernandez-Guerra, Samir Suweis, Romain Narci, Cédric Berney, Damien Eveillard, Frédérick Gavory, Lionel Guidi, Karine Labadie, Eric Mahieu, Julie Poulain, Sarah Romac, Simon Roux, Céline Dimier, Stefanie Kandels, Marc Picheral, Sarah Searson, Stéphane Pesant, Jean-Marc Aury, Jennifer Brum, Claire Lemaitre, Eric Pelletier, Peer Bork, Shinichi Sunagawa, Lee Karp-Boss, Chris Bowler, Matthew Sullivan, Eric Karsenti, Mahendra Mariadassou, Ian Probert, Pierre Peterlongo, Patrick Wincker, Colomban de Vargas, Maurizio Ribera d’Alcalà, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon, Tom O. Delmont
- article
- eLife, 2022, 11, pp.e78129. ⟨10.7554/eLife.78129⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep learning for assessing the aesthetics of professional photographs
- auteur
- Mathieu Chambe, Rémi Cozot, Olivier Le Meur
- article
- Computer Animation and Virtual Worlds, 2022, pp.14. ⟨10.1002/cav.2105⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- On computing evidential centroid through conjunctive combination: an impossibility theorem
- auteur
- Yiru Zhang, Sébastien Destercke, Zuowei Zhang, Tassadit Bouadi, Arnaud Martin
- article
- IEEE Transactions on Artificial Intelligence, 2022, pp.1-10. ⟨10.1109/TAI.2022.3180973⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Addressing barriers in comprehensiveness, accessibility, reusability, interoperability and reproducibility of computational models in systems biology
- auteur
- Anna Niarakis, Dagmar Waltemath, James Glazier, Falk Schreiber, Sarah Keating, David Nickerson, Claudine Chaouiya, Anne Siegel, Vincent Noël, Henning Hermjakob, Tomáš Helikar, Sylvain Soliman, Laurence Calzone
- article
- Briefings in Bioinformatics, 2022, 23 (4), pp.1-11. ⟨10.1093/bib/bbac212⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Spodoptera littoralis genome mining brings insights on the dynamic of expansion of gustatory receptors in polyphagous noctuidae
- auteur
- Camille Meslin, Pauline Mainet, Nicolas Montagné, Stéphanie Robin, Fabrice Legeai, Anthony Bretaudeau, J Spencer Johnston, Fotini A. Koutroumpa, Emma Persyn, Christelle Monsempès, Marie-Christine François, Emmanuelle Jacquin-Joly
- article
- G3, 2022, 12 (8), pp.jkac131. ⟨10.1093/g3journal/jkac131⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Diversity and Inclusion Activities in EGC – A 2022 Report
- auteur
- Sihem Amer-Yahia, Angela Bonifati, Cécile Favre, Elisa Fromont, Nicolas Labroche, Guy Melançon, Florence Sèdes, Arnaud Soulet, Alexandre Termier
- article
- SIGKDD explorations : newsletter of the Special Interest Group (SIG) on Knowledge Discovery & Data Mining, 2022, 24 (1), pp.52-56. ⟨10.1145/3544903.3544911⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- EnosLib: A Library for Experiment-Driven Research in Distributed Computing
- auteur
- Ronan-Alexandre Cherrueau, Marie Delavergne, Alexandre van Kempen, Adrien Lebre, Dimitri Pertin, Javier Rojas Balderrama, Anthony Simonet, Matthieu Simonin
- article
- IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems, 2022, 33 (6), pp.1464-1477. ⟨10.1109/TPDS.2021.3111159⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the Universality of Atomic and Molecular Logics via Protologics
- auteur
- Guillaume Aucher
- article
- Logica Universalis, 2022, 16 (1-2), pp.285-322. ⟨10.1007/s11787-022-00298-5⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- kmtricks: Efficient construction of Bloom filters for large sequencing data collections
- auteur
- Téo Lemane, Paul Medvedev, Rayan Chikhi, Pierre Peterlongo
- article
- Bioinformatics Advances, 2022, ⟨10.1093/bioadv/vbac029⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Décoder le génome : vers la compréhension du fonctionnement du SARS-CoV-2
- auteur
- Hélène Touzet, Mikaël Salson, Claire Lemaitre
- article
- Interstices, 2022
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Critical Assessment of Metagenome Interpretation: the second round of challenges
- auteur
- Fernando Meyer, Adrian Fritz, Zhi-Luo Deng, David Koslicki, Till Robin Lesker, Alexey Gurevich, Gary Robertson, Mohammed Alser, Dmitry Antipov, Francesco Beghini, Denis Bertrand, Jaqueline Brito, C. Titus Brown, Jan Buchmann, Aydin Buluç, Bo Chen, Rayan Chikhi, Philip Clausen, Alexandru Cristian, Piotr Wojciech Dabrowski, Aaron Darling, Rob Egan, Eleazar Eskin, Evangelos Georganas, Eugene Goltsman, Melissa Gray, Lars Hestbjerg Hansen, Steven Hofmeyr, Pingqin Huang, Luiz Irber, Huijue Jia, Tue Sparholt Jørgensen, Silas Kieser, Terje Klemetsen, Axel Kola, Mikhail Kolmogorov, Anton Korobeynikov, Jason Kwan, Nathan Lapierre, Claire Lemaitre, Chenhao Li, Antoine Limasset, Fabio Malcher-Miranda, Serghei Mangul, Vanessa Marcelino, Camille Marchet, Pierre Marijon, Dmitry Meleshko, Daniel Mende, Alessio Milanese, Niranjan Nagarajan, Jakob Nissen, Sergey Nurk, Leonid Oliker, Lucas Paoli, Vitor Piro, Jacob Porter, Simon Rasmussen, Evan Rees, Knut Reinert, Bernhard Renard, Espen Mikal Robertsen, Gail Rosen, Hans-Joachim Ruscheweyh, Varuni Sarwal, Nicola Segata, Enrico Seiler, Lizhen Shi, Fengzhu Sun, Shinichi Sunagawa, Søren Johannes Sørensen, Ashleigh Thomas, Chengxuan Tong, Mirko Trajkovski, Julien Tremblay, Gherman Uritskiy, Riccardo Vicedomini, Zhengyang Wang, Ziye Wang, Zhong Wang, Andrew Warren, Nils Peder Willassen, Katherine Yelick, Ronghui You, Georg Zeller, Zhengqiao Zhao, Shanfeng Zhu, Jie Zhu, Ruben Garrido-Oter, Petra Gastmeier, Stephane Hacquard, Susanne Häußler, Ariane Khaledi, Friederike Maechler, Fantin Mesny, Simona Radutoiu, Paul Schulze-Lefert, Nathiana Smit, Till Strowig, Andreas Bremges, Alexander Sczyrba, Alice Carolyn Mchardy, Pierre Peterlongo
- article
- Nature Methods, 2022, 19 (4), pp.429-440. ⟨10.1038/s41592-022-01431-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Visual Servoing in Autoencoder Latent Space
- auteur
- Samuel Felton, Pascal Brault, Elisa Fromont, Eric Marchand
- article
- IEEE Robotics and Automation Letters, 2022, 7 (2), pp.3234-3241. ⟨10.1109/LRA.2022.3144490⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The genomic basis of the Streptococcus thermophilus health-promoting properties
- auteur
- Emeline Roux, Aurélie Nicolas, Florence Valence, Grégoire Siekaniec, Victoria Chuat, Jacques Nicolas, Yves Le Loir, Eric Guédon
- article
- BMC Genomics, 2022, 23, pp.1-23. ⟨10.1186/s12864-022-08459-y⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Hide and Mine in Strings: Hardness, Algorithms, and Experiments
- auteur
- Giulia Bernardini, Alessio Conte, Garance Gourdel, Roberto Grossi, Grigorios Loukides, Nadia Pisanti, Solon Pissis, Giulia Punzi, Leen Stougie, Michelle Sweering
- article
- IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, 2022, pp.1-6. ⟨10.1109/TKDE.2022.3158063⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- EXOSC10/Rrp6 is essential for the eight-cell embryo/morula transition
- auteur
- Fabrice G. Petit, Soazik P. Jamin, Pierre-Yves Kernanec, Emmanuelle Becker, Guillaume Halet, Michael Primig
- article
- Developmental Biology, 2022, 483, pp.58-65. ⟨10.1016/j.ydbio.2021.12.010⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- XEM: An explainable-by-design ensemble method for multivariate time series classification
- auteur
- Kevin Fauvel, Elisa Fromont, Véronique Masson, Philippe Faverdin, Alexandre Termier
- article
- Data Mining and Knowledge Discovery, 2022, 36 (3), pp.917-957. ⟨10.1007/s10618-022-00823-6⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Large-scale Empirical Analysis of Browser Fingerprints Properties for Web Authentication
- auteur
- Nampoina Andriamilanto, Tristan Allard, Gaëtan Le Guelvouit, Alexandre Garel
- article
- ACM Transactions on the Web, 2022, 16 (1), pp.1–62. ⟨10.1145/3478026⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a reproducible interactome: semantic-based detection of redundancies to unify protein-protein interaction databases
- auteur
- Marc Melkonian, Camille Juigné, Olivier Dameron, Gwenaël Rabut, Emmanuelle Becker
- article
- Bioinformatics, 2022, Proceedings, 38 (6), pp.1-7. ⟨10.1093/bioinformatics/btac013⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Disease progression score estimation from multimodal imaging and microRNA data using supervised variational autoencoders
- auteur
- Virgilio Kmetzsch, Emmanuelle Becker, Dario Saracino, Daisy Rinaldi, Agnes Camuzat, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot
- article
- IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2022, 26 (12), pp.1-12. ⟨10.1109/JBHI.2022.3208517⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Masculinization of the X-chromosome in aphid soma and gonads
- auteur
- Julie Jaquiéry, Jean-Christophe Simon, Stéphanie Robin, Gautier Richard, Jean Peccoud, Hélène Boulain, Fabrice Legeai, Sylvie Tanguy, Nathalie Prunier Leterme, Gaël Le Trionnaire
- article
- Peer Community Journal, 2022, 2, pp.e53. ⟨10.24072/pcjournal.166⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Anomaly Explanation : A Review
- auteur
- Véronne Yepmo, Grégory Smits, Olivier Pivert
- article
- Data and Knowledge Engineering, 2022, 137, pp.101946
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Impact of Data Cleansing for Urban Bus Commercial Speed Prediction
- auteur
- Gauthier Lyan, David Gross-Amblard, Jean-Marc Jézéquel, Simon Malinowski
- article
- SN Computer Science, 2022, 3 (82), pp.1-11. ⟨10.1007/s42979-021-00966-1⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Identifying genes with conserved splicing structure and orthologous isoforms in human, mouse and dog
- auteur
- Nicolas Guillaudeux, Catherine Belleannée, Samuel Blanquart
- article
- BMC Genomics, 2022, 23 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s12864-022-08429-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- BSC: Belief Shift Clustering
- auteur
- Zuo-Wei Zhang, Zhun-Ga Liu, Arnaud Martin, Kuang Zhou
- article
- IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics: Systems, 2022, pp.1-13. ⟨10.1109/TSMC.2022.3205365⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SECURE-GEGELATI Always-On Intrusion Detection through GEGELATI Lightweight Tangled Program Graphs
- auteur
- Nicolas Sourbier, Karol Desnos, Thomas Guyet, Frédéric Majorczyk, Olivier Gesny, Maxime Pelcat
- article
- Journal of Signal Processing Systems, 2022, Design and Architectures for Signal and Image Processing 2021, 94 (7), pp.753-770. ⟨10.1007/s11265-021-01728-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-omic investigation of low-nitrogen conditional resistance to clubroot reveals Brassica napus genes involved in nitrate assimilation
- auteur
- Y Aigu, Stéphanie Daval, Kévin Gazengel, Nathalie Marnet, C Lariagon, Anne Laperche, F Legeai, Maria J Manzanares-Dauleux, Antoine Gravot
- article
- Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.790563. ⟨10.3389/fpls.2022.790563⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Precision feeding of lactating sows: implementation and evaluation of a decision support system in farm conditions
- auteur
- Raphaël Gauthier, Christine Largouët, Dan Bussières, Jean-Philippe Martineau, Jean-Yves Dourmad
- article
- Journal of Animal Science, 2022, pp.1-40. ⟨10.1093/jas/skac222⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MicroRNA signatures in genetic frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis
- auteur
- Virgilio Kmetzsch, Morwena Latouche, Dario Saracino, Daisy Rinaldi, Agnès Camuzat, Thomas Gareau, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot, Emmanuelle Becker
- article
- Annals of Clinical and Translational Neurology, 2022, pp.1-14. ⟨10.1002/acn3.51674⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Learning a credal classifier with optimized and adaptive multi-estimation for missing data imputation
- auteur
- Zuo-Wei Zhang, Hong-Peng Tian, Ling-Zhi Yan, Arnaud Martin, Kuang Zhou
- article
- IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics: Systems, 2022, 52 (7), pp.4092-4104
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Discrete modeling for integration and analysis of large-scale signaling networks
- auteur
- Pierre Vignet, Jean Coquet, Sébastien Aubert, Matéo Boudet, Anne Siegel, Nathalie Théret
- article
- PLoS Computational Biology, 2022, 18 (6), pp.e1010175. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010175⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MERRIN: MEtabolic Regulation Rule INference from time series data
- auteur
- Kerian Thuillier, Caroline Baroukh, Alexander Bockmayr, Ludovic Cottret, Loïc Paulevé, Anne Siegel
- article
- Bioinformatics, 2022, 38 (Supplement_2), pp.ii127-ii133. ⟨10.1093/bioinformatics/btac479⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- The Lannion report on Big Data and Security Monitoring Research
- auteur
- Laurent d’Orazio, Jalil Boukhobza, Omer Rana, Juba Agoun, Le Gruenwald, Hervé Rannou, Elisa Bertino, Mohand-Saïd Hacid, Taofik Saïdi, Georges Bossert, VanLong Nguyen Huu, Dimitri Tombroff, Makoto Onizuka
- article
- Workshop on Big Data for CyberSecurity (BigCyber-2022), Dec 2022, Osaka, Japan. pp.2960-2969, ⟨10.1109/BigData55660.2022.10020852⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A method to identify target molecules and extract the corresponding graph of interactions in BioPAX
- auteur
- Camille Juigné, Olivier Dameron, Florence Gondret, Emmanuelle Becker
- article
- BBCC2022 – Bioinformatics and Computational Biology Conference, Dec 2022, Virtual, Italy
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The french INRIA- INRAE White Book “Agriculture and digital technologies” – Coupling digitalization and agroecology to design more sustainable and resilient food systems
- auteur
- Véronique Bellon Maurel, Ludovic Brossard, Frédérick Garcia, Nathalie Mitton, Alexandre Termier
- article
- NARO 2022 – 2nd International Symposium on Food and Health “Global Food Security and Human Health -Toward Transforming the Food System with Advanced Technology-”, Dec 2022, virtuel, Japan
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Prédiction des épidémies de cercosporiose de la betterave par des approches d’apprentissage automatique.
- auteur
- Lucile Vallet, François Brun, Olivier Gauriau, François Joudelat, Céline Gouwie, Ghislain Malatesta, Juliette Adrian, Fabienne Maupas
- article
- VÉGÉPHYL -13ème Conférence internationale sur les maladies des plantes, Dec 2022, Orléans, France. pp.1-3
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DNA Storage: Synthesis and Sequencing Semiconductor Technologies
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- IEDM 2022 – 68th Annual IEEE International Electron Devices Meeting, Dec 2022, San Francisco, United States. pp.1-4
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Intégration de données de phénotypiques, environnementales et de biodiversité à l’aide des technologies du Web Sémantique
- auteur
- Olivier Dameron, Yael Tirlet, Matéo Boudet, Fabrice Legeai
- article
- SYSINFO-INRAe 2022 – Journées INRAE systèmes d’information pour les données agro-environnementales, Nov 2022, Clermont-Ferrand, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- HairSplitter: assembling long reads in an unknown number of haplotypes
- auteur
- Roland Faure, Jean-François Flot, Dominique Lavenier
- article
- SeqBIM 2022 – Journées sur les Séquences en Bioinformatique, Informatique et Mathématiques, Nov 2022, Bordeaux, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Pattern matching under DTW distance
- auteur
- Garance Gourdel, Anne Driemel, Pierre Peterlongo, Tatiana Starikovskaya
- article
- SPIRE 2022 – 29th International Symposium on String Processing and Information Retrieval, Nov 2022, Concepción, Chile. pp.315–330
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CATREEN : Context-Aware Code Timing Estimation with Stacked Recurrent Networks
- auteur
- Abderaouf Amalou, Elisa Fromont, Isabelle Puaut
- article
- ICTAI 2022 – 34th IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Oct 2022, Virtually, China. pp.1-6, ⟨10.1109/ICTAI56018.2022.00090⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ASSIST: Outil pour l’extraction et l’analyse statistique d’articles
- auteur
- Justine Fouillé, Thi Lan Huong Nguyen, Baptiste Alix, Brett Becker, Matthieu Rochard, Hélène de Ribaupierre, Laurent d’Orazio
- article
- EDA 2022 : 18ème journées Business Intelligence & Big Data, Oct 2022, Clermont- Ferrand, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reliability-Based Imbalanced Data Classification with Dempster-Shafer Theory
- auteur
- Hongpeng Tian, Zuowei Zhang, Arnaud Martin, Zhunga Liu
- article
- 7th International Conference on Belief Functions, Oct 2022, PARIS, France. ⟨10.1007/978-3-031-17801-6_8⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Real bird dataset with imprecise and uncertain values
- auteur
- Constance Thierry, Arthur Hoarau, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- 7th International Conference on Belief Functions, Oct 2022, Paris, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Belief functions on ordered frames of discernment
- auteur
- Arnaud Martin
- article
- 7th International Conference on Belief Functions (BELIEF2022), BFAS, Oct 2022, Paris, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Imperfect Labels with Belief Functions for Active Learning
- auteur
- Arthur Hoarau, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- Belief Functions: Theory and Applications, Oct 2022, Paris, France. pp.44-53, ⟨10.1007/978-3-031-17801-6_5⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Gestion de données efficace dans les bases de connaissances
- auteur
- Wafaa El Husseini, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Hélène Jaudoin
- article
- BDA 2022 – 38èmes journées de la conférence BDA « Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications », Oct 2022, Clermont-Ferrand, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards Speeding Up Graph-Relational Queries in RDBMSs
- auteur
- Angelos Christos Anadiotis, François Goasdoué, Mhd Yamen Haddad, Ioana Manolescu
- article
- BDA 2022 – 38èmes journées de la conférence BDA « Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications, Oct 2022, Clermont-Ferrand, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- OptiRef : optimisation pour la gestion de données dans les bases de connaissances
- auteur
- Wafaa El Husseini, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Hélène Jaudoin
- article
- BDA 2022 – 38èmes journées de la conférence BDA « Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications », Oct 2022, Clermont-Ferrand, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Exploration de données massives à l’aide d’estimations de cardinalités
- auteur
- Pierre Nerzic, Grégory Smits, Olivier Pivert, Marie-Jeanne Lesot
- article
- LFA 2022 – Rencontres francophones sur la logique floue et ses applications, Oct 2022, Toulouse, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- PANDA : Personnaliser les ANomalies Détectées par Apprentissage
- auteur
- Grégory Smits, Marie-Jeanne Lesot, Véronne Yepmo, Olivier Pivert
- article
- LFA 2022 – Rencontres francophones sur la logique floue et ses applications, Oct 2022, Toulouse, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- When Should We Use Linear Explanations?
- auteur
- Julien Delaunay, Luis Galárraga, Christine Largouët
- article
- CIKM 2022 – 31st ACM International Conference on Information and Knowledge Management, ACM, Oct 2022, Atlanta, United States. pp.355-364, ⟨10.1145/3511808.3557489⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- QuickFill, QuickMixte : approches par blocs pour la réduction du nombre de programmes en synthèse de programmes
- auteur
- Vanessa Fokou, Peggy Cellier, Maurice Tchuente, Alexandre Termier
- article
- CARI 2022 – Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2022, Yaoundé, Cameroun. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Contributions des entrées sur les sorties pour les réseaux métaboliques sur génomes entiers: performances et utilisation pour des études en nutrition humaine
- auteur
- Oumarou Abdou Arbi, Anne Siegel, Jérémie Bourdon
- article
- CARI 2022 – Colloque Africain sur la Recherche en Informatique et en Mathématiques Appliquées, Oct 2022, Yaoundé, Cameroun. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- VCNet: A self-explaining model for realistic counterfactual generation
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Thomas Guyet, Tassadit Bouadi, Alexandre Termier
- article
- ECML PKDD 2022 – European Conference on Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases., Sep 2022, Grenoble, France. pp.1-16
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multi-objective query optimization in Spark SQL
- auteur
- Michail Georgoulakis, Verena Kantere, Laurent D’orazio
- article
- IDEAS 2022 – International Database Engineered Applications Symposium, Aug 2022, Budapest, Hungary
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SLA-Aware Cloud Query Processing with Reinforcement Learning-based Multi-Objective Re-Optimization
- auteur
- Chenxiao Wang, Le Gruenwald, Laurent d’Orazio
- article
- DAWAK 2022 – International Conference on Data Warehousing and Knowledge Discovery, Aug 2022, Vienna, Austria
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Massive Data Exploration using Estimated Cardinalities
- auteur
- Pierre Nerzic, Grégory Smits, Olivier Pivert, Marie-Jeanne Lesot
- article
- WCCI 2022 – IEEE World Congress on Computational Intelligence, Jul 2022, Padoue, Italy
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- UniRank: Unimodal Bandit Algorithm for Online Ranking
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Elisa Fromont
- article
- ICML 2022 – 39th International Conference on Machine Learning, Jul 2022, Baltimore, United States. pp.1-31
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Membership Inference Attacks on Aggregated Time Series with Linear Programming
- auteur
- Antonin Voyez, Tristan Allard, Gildas Avoine, Pierre Cauchois, Elisa Fromont, Matthieu Simonin
- article
- SECRYPT 2022 – 19th International Conference on Security and Cryptography, Jul 2022, Lisbon, France. pp.193-204, ⟨10.5220/0011276100003283⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- PANDA: Human-in-the-Loop Anomaly Detection and Explanation
- auteur
- Grégory Smits, Marie-Jeanne Lesot, Véronne Yepmo, Olivier Pivert
- article
- IPMU 2022 – Information Processing and Management of Uncertainty in Knowledge-Based Systems, Jul 2022, Milan, Italy
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- S-LIME : reconcilier localité et fidélité des explications linéaires
- auteur
- Romaric Gaudel, Luis Galárraga, Julien Delaunay, Laurence Roze, Vaishnavi Bhargava
- article
- CAP – RFIAP 2022 – Conférence française sur l’apprentissage machine – Reconnaissance de formes, Images, Apprentissage et Perception, Jul 2022, Vannes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Detection and correction of non-conformities and redundancies in complexes of molecules in BioPAX
- auteur
- Camille Juigné, Olivier Dameron, François Moreews, Florence Gondret, Emmanuelle Becker
- article
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. pp.1-25
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal Scaffolding for Chloroplasts’ Inverted Repeats
- auteur
- Victor Epain, Rumen Andonov, Dominique Lavenier
- article
- JOBIM2022, Jul 2022, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- UniRank : un algorithme de bandit générique pour l’ordonnancement en ligne
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Élisa Fromont
- article
- CAP – RFIAP 2022 – Conférence française sur l’apprentissage machine – Reconnaissance de formes, Images, Apprentissage et Perception, Elisa Fromont et Nicolas Courty, Jul 2022, Vannes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Highlight on Computing disease progression scores using multimodal variational autoencoders trained with neuroimaging and microRNA data
- auteur
- Virgilio Kmetzsch, Emmanuelle Becker, Dario Saracino, Vincent Anquetil, Daisy Rinaldi, Agnès Camuzat, Thomas Gareau, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot
- article
- Jobim 2022 – Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2022, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Highlight on semantic web technologies are effective to remove redundancies from protein-protein interaction databases and define reproducible interactomes
- auteur
- Marc Melkonian, Camille Juigné, Olivier Dameron, Gwenaël Rabut, Emmanuelle Becker
- article
- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. pp.146
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimisation du Positionnement de Voitures en Autopartage basée sur la Prédiction de leur Utilité
- auteur
- Gregory Martin, Matthieu Donain, Elisa Fromont, Tias Guns, Laurence Roze, Alexandre Termier
- article
- Conférence Nationale en Intelligence Artificielle 2022 (CNIA 2022), Jun 2022, Saint-Etienne, France. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Construction de Graphes de Connaissance à partir de textes avec une I.A. centrée-utilisateur
- auteur
- H. Ambre Ayats
- article
- TALN 2022 – 29e Conférence sur le Traitement Automatique des Langues Naturelles, Jun 2022, Avignon, France. pp.33-46
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Processing-in-Memory to speed up NGS analysis
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- SFA²F 2022 – Sequencing to Function: Analysis and Application for the Future, Jun 2022, Santa Fe, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- CONNOR: Exploring Similarities in Graphs with Concepts of Neighbors
- auteur
- H. Ambre Ayats, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- ETAFCA 2022 – Existing Tools and Applications for Formal Concept Analysis, Jun 2022, Tallinn, Estonia. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Exploring the Application of Graph-FCA to the Problem of Knowledge Graph Alignment
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- CLA 2022 – 16th International Conference on Concept Lattices and Their Applications, Jun 2022, Tallinn, Estonia. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modeling Complex Structures in Graph-FCA: Illustration on Natural Language Syntax
- auteur
- Sébastien Ferré, Peggy Cellier
- article
- ETAFCA 2022 – Existing Tools and Applications for Formal Concept Analysis, Jun 2022, Tallinn, Estonia. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cache management in MASCARA-FPGA: from coalescing heuristic to replacement policy
- auteur
- Van Long Nguyen Huu, Julien Lallet, Emmanuel Casseau, Laurent d’Orazio
- article
- DaMoN 2022 – 18th International Workshop on Data Management on New Hardware, Jun 2022, Philadelphia, United States. pp.1-5, ⟨10.1145/3533737.3535096⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Iterated Dependencies in a Breton treebank and implications for a Categorial Dependency Grammar
- auteur
- Annie Foret, Denis Béchet, Valérie Bellynck
- article
- Proceedings of the 4th Celtic Language Technology Workshop within LREC2022, Jun 2022, Marseille, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards a Graph-Oriented Perspective for Querying Music Scores
- auteur
- Philippe Rigaux, Virginie Thion
- article
- Proceedings of the INFORSID conference, May 2022, Dijon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Clock-G: A temporal graph management system with space-efficient storage technique
- auteur
- Maria Massri, Zoltan Miklos, Philippe Raipin, Pierre Meye
- article
- International Conference on Data Engineering (ICDE 2022), May 2022, Kuala Lumpur, Malaysia
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Générer des explications contrefactuelles à l’aide d’un autoencodeur supervisé
- auteur
- Victor Guyomard, Françoise Fessant, Tassadit Bouadi, Thomas Guyet
- article
- Extraction et Gestion des Connaissances, EGC’2022, Apr 2022, Blois, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- s-LIME: Reconciling Locality and Fidelity in Linear Explanations
- auteur
- Romaric Gaudel, Luis Galárraga, Julien Delaunay, Laurence Rozé, Vaishnavi Bhargava
- article
- IDA 2022 – Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2022, Rennes, France. pp.1-13
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Two-Step Approach for Explainable Relation Extraction
- auteur
- H. Ambre Ayats, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- IDA 2022 – Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2022, Rennes, France. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- RTGEN : A Relative Temporal Graph GENerator
- auteur
- Maria Massri, Zoltan Miklos, Philippe Raipin, Pierre Meye
- article
- DATAPLAT workshop at the EDBT/ICDT 2022 Joint Conference, Mar 2022, Edinburgh, United Kingdom
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From Cloud to Serverless: MOO in the new Cloud epoch
- auteur
- Michail Georgoulakis Misegiannis, Laurent D’orazio, Verena Kantere
- article
- International Conference on Extending Database Technology (EDBT), Mar 2022, Virtual, United Kingdom. ⟨10.48786/edbt.2022.58⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A first proposal for secure data storage into DNA molecules compliant with biological constraints
- auteur
- Chloé Berton, Gouenou Coatrieux, Dominique Lavenier
- article
- DSMM 2022 – 1st International Conference on Data Storage in Molecular Media, Mar 2022, Virtual, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Experimental DNA storage platform
- auteur
- Olivier Boullé, Dominique Lavenier
- article
- DSMM 2022 – 1st International Conference on Data Storage in Molecular Media, Mar 2022, Virtual, France. pp.1-1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- RISCLESS: A Reinforcement Learning Strategy to Guarantee SLA on Cloud Ephemeral and Stable Resources
- auteur
- Sidahmed Yalles, Mohamed Handaoui, Jean-Emile Dartois, Olivier Barais, Laurent d’Orazio, Jalil Boukhobza
- article
- 2022 30th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and Network-Based Processing (PDP), Mar 2022, Valladolid, Spain. pp.83-87, ⟨10.1109/PDP55904.2022.00021⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Linear integer programming approach for chloroplast genome scaffolding
- auteur
- Victor Epain, Rumen Andonov
- article
- 23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d’Aide à la Décision, INSA Lyon, Feb 2022, Lyon, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- TAG: Learning Timed Automata from Logs
- auteur
- Lénaïg Cornanguer, Christine Largouët, Laurence Rozé, Alexandre Termier
- article
- AAAI 2022 – 36th AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2022, Virtual, Canada. pp.1-9
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- XPM: An explainable-by-design pattern-based estrus detection approach to improve resource use in dairy farms
- auteur
- Issei Harada, Kevin Fauvel, Thomas Guyet, Véronique Masson, Alexandre Termier, Philippe Faverdin
- article
- AAAI 2022 – 36th AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2022, Vancouver, Canada. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- A multimodal variational autoencoder for estimating progression scores from imaging and microRNA data in rare neurodegenerative diseases
- auteur
- Virgilio Kmetzsch, Emmanuelle Becker, Dario Saracino, Vincent Anquetil, Daisy Rinaldi, Agnès Camuzat, Thomas Gareau, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot
- article
- SPIE Medical Imaging 2022: Image Processing, Feb 2022, San Diego, California, United States. pp.376-382, ⟨10.1117/12.2607250⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Kartu-Verbs : un système d’informations logiques de formes verbales fléchies pour contourner les problèmes de lemmatisation des verbes géorgiens
- auteur
- Mireille Ducassé
- article
- EGC 2022 – Conférence francophone sur l’Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2022, Blois, France. pp.421-428
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Low-cost Multispectral Scene Analysis with Modality Distillation
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- WACV 2022 – IEEE Winter Conference on Applications of Computer Vision, Jan 2022, Waikoloa /Virtual, United States. pp.1-10, ⟨10.1109/WACV51458.2022.00339⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
Book sections
- titre
- The rule-based model approach. A Kappa model for hepatic stellate cells activation by TGFB1
- auteur
- Matthieu Bouguéon, Pierre Boutillier, Jérôme Feret, Octave Hazard, Nathalie Théret
- article
- Elisabetta De Maria. Systems Biology Modelling and Analysis: Formal Bioinformatics Methods and Tools, Wiley, pp.1-76, 2022, 978-1-119-71653-2
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Genome Assembly
- auteur
- Dominique Lavenier
- article
- From Sequences to Graphs: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics – SCIENCES – Bioinformatics – ISTE Wiley, 2022, 9781789450668
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Metagenomics and Metatranscriptomics
- auteur
- Cervin Guyomar, Claire Lemaitre
- article
- From Sequences to Graphs: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics, ISTE, 2022, 9781789450668
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Méthodes du Web sémantique pour l’intégration de données en sciences de la vie
- auteur
- Olivier Dameron
- article
- Intégration de données biologiques, ISTE Group, pp.1-30, 2022, 9781789480306
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Problèmes d’optimisation combinatoire pour l’étude du métabolisme
- auteur
- Clémence Frioux, Anne Siegel
- article
- Approches symboliques de la modélisation et de l’analyse des systèmes biologiques, ISTE éditions, 2022, Encyclopédie Sciences, 9781789480290. ⟨10.51926/ISTE.9029.ch2⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Streaming Regular Expression Membership and Pattern Matching
- auteur
- Bartłomiej Dudek, Paweł Gawrychowski, Garance Gourdel, Tatiana Starikovskaya
- article
- Proceedings of the 2022 Annual ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms (SODA), Society for Industrial and Applied Mathematics, pp.670-694, 2022, ⟨10.1137/1.9781611977073.30⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Les défis de demain
- auteur
- Ludovic Brossard, Véronique Bellon Maurel, Pierre Bisquert, Tassadit Bouadi, Frédérick Garcia, Roland Lenain, Pierre P. Labarthe, Evelyne Lutton, Pierre Maurel, Nathalie Mitton, Alexandre Termier
- article
- Agriculture et numérique : Tirer le meilleur du numérique pour contribuer à la transition vers des agricultures et des systèmes alimentaires durables, 6, INRIA, pp.120-143, 2022, Livre blanc INRIA
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Foundations and state of the art
- auteur
- Nathalie Mitton, Ludovic Brossard, Tassadit Bouadi, Frédérick Garcia, Romain Gautron, Nadine Hilgert, Dino Ienco, Christine Largouët, Evelyne Lutton, Véronique Masson, Roger Martin-Clouaire, Marie-Laure Mugnier, Pascal Neveu, Philippe Preux, Helene Raynal, Catherine Roussey, Alexandre Termier, Véronique Bellon Maurel
- article
- Agriculture and Digital Technology: Getting the most out of digital technology to contribute to the transition to sustainable agriculture and food systems, 6, INRIA, pp.30-75, 2022, White book Inrira
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Conceptual Navigation in Large Knowledge Graphs
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- Springer. Complex Data Analytics with Formal Concept Analysis, Springer, pp.1-30, 2022
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Challenges for the future
- auteur
- Ludovic Brossard, Véronique Bellon Maurel, Pierre Bisquert, Tassadit Bouadi, Frédérick Garcia, Roland Lenain, Pierre P. Labarthe, Evelyne Lutton, Pierre Maurel, Nathalie Mitton, Alexandre Termier
- article
- Agriculture and Digital Technology: Getting the most out of digital technology to contribute to the transition to sustainable agriculture and food systems, 6, pp.112-134, 2022, White book Inria, 978-2-7261-1310-3
- typdoc
- Book sections
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- From homogeneous data to heterogeneous data in systems biology
- auteur
- Emmanuelle Becker
- article
- Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Rennes 1, 2022
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
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-
Books
- titre
- Advances in Knowledge Discovery and Management, Volume 9
- auteur
- Rakia Jaziri, Arnaud Martin, Marie-Christine Rousset, Lydia Boudjeloud-Assala, Fabrice Guillet
- article
- Springer Internation Publishing 2022; Springer International Publishing, 1004, 2022, Studies in Computational Intelligence, 9783030902865. ⟨10.1007/978-3-030-90287-2⟩
- typdoc
- Books
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-
- titre
- Agriculture et numérique
- auteur
- Véronique Bellon Maurel, Ludovic Brossard, Frédérick Garcia, Nathalie Mitton, Alexandre Termier
- article
- INRIA, pp.1-195, 2022, ⟨10.17180/wmkb-ty56⟩
- typdoc
- Books
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-
- titre
- Agriculture and Digital Technology
- auteur
- Véronique Bellon Maurel, Ludovic Brossard, Frédérick Garcia, Nathalie Mitton, Alexandre Termier
- article
- pp.1-185, 2022, ⟨10.17180/wmkb-ty56-en⟩
- typdoc
- Books
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-
Theses
- titre
- Designing a temporal graph management system for IoT application domains
- auteur
- Maria Massri
- article
- Databases [cs.DB]. Université de Rennes, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S103⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Characterization in functional modules of ADAMTS-TSL proteins, by phylogeny approaches
- auteur
- Olivier Dennler
- article
- Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2022. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Indexing and analysis of large sequencing collections using k-mer matrices
- auteur
- Téo Lemane
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S127⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Haplotype phasing from long reads with ASP : a flexible optimization approach
- auteur
- Clara Delahaye
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S093⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Semantic caching framework towards FPGA acceleration for range query processing in domain of massive distributed data
- auteur
- Huu van Long Nguyen
- article
- Other [cs.OH]. Université de Rennes, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S094⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Combining knowledge-based and sequence comparison approaches to elucidate metabolic functions, from pathways to communities
- auteur
- Arnaud Belcour
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S061⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multimodal analysis of neuroimaging and transcriptomic data in genetic frontotemporal dementia
- auteur
- Virgilio Kmetzsch
- article
- Machine Learning [stat.ML]. Sorbonne Université, 2022. English. ⟨NNT : 2022SORUS279⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- List recommendations with multi-armed bandits
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université de Rennes, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S023⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification and quantification of microbial strains in metagenomic samples using variation graphs
- auteur
- Kévin da Silva
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes 1, 2022. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Representation of uncertainty and imprecision between clusters with belief functions
- auteur
- Zuowei Zhang
- article
- Other [cs.OH]. Université de Rennes; Northwestern Polytechnical University (X’ian, Chine), 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1S003⟩
- typdoc
- Theses
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-
2021
Journal articles
- titre
- XCM: An Explainable Convolutional Neural Network for Multivariate Time Series Classification
- auteur
- Kevin Fauvel, Tao Lin, Véronique Masson, Élisa Fromont, Alexandre Termier
- article
- Mathematics , 2021, 9 (23), pp.1-20. ⟨10.3390/math9233137⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Global patterns in genomic diversity underpinning the evolution of insecticide resistance in the aphid crop pest Myzus persicae
- auteur
- Kumar Saurabh Singh, Erick Cordeiro, Bartlomiej Troczka, Adam Pym, Joanna Mackisack, Thomas Mathers, Ana Duarte, Fabrice Legeai, Stéphanie Robin, Pablo Bielza, Hannah Burrack, Kamel Charaabi, Ian Denholm, Christian Figueroa, Richard Ffrench-Constant, Georg Jander, John Margaritopoulos, Emanuele Mazzoni, Ralf Nauen, Claudio Ramírez, Guangwei Ren, Ilona Stepanyan, Paul Umina, Nina Voronova, John Vontas, Martin Williamson, Alex Wilson, Gao Xi-Wu, Young-Nam Youn, Christoph Zimmer, Jean-Christophe Simon, Alex Hayward, Chris Bass
- article
- Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.847. ⟨10.1038/s42003-021-02373-x⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- PPalign: optimal alignment of Potts models representing proteins with direct coupling information
- auteur
- Hugo Talibart, François Coste
- article
- BMC Bioinformatics, 2021, 22 (317), pp.1-22. ⟨10.1186/s12859-021-04222-4⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Scalable long read self-correction and assembly polishing with multiple sequence alignment
- auteur
- Pierre Morisse, Camille Marchet, Antoine Limasset, Thierry Lecroq, Arnaud Lefebvre
- article
- Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-020-80757-5⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparative transcriptome analysis at the onset of speciation in a mimetic butterfly—The Ithomiini Melinaea marsaeus
- auteur
- Florence Piron-Prunier, Emma Persyn, Fabrice Legeai, Melanie Mcclure, Camille Meslin, Stéphanie Robin, Susete Alves Carvalho, Ammara Mohammad, Corinne Blugeon, Emmanuelle Jacquin‐joly, Nicolas Montagné, Marianne Elias, Jérémy Gauthier
- article
- Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (11), pp.1704-1721. ⟨10.1111/jeb.13940⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Sequencing DNA with nanopores: Troubles and biases
- auteur
- Clara Delahaye, Jacques Nicolas
- article
- PLoS ONE, 2021, 16 (10), pp.e0257521. ⟨10.1371/journal.pone.0257521⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reducing the Cost of Aggregation in Crowdsourcing
- auteur
- Rituraj Singh, Loïc Hélouët, Zoltan Miklos
- article
- Transactions on Large-Scale Data- and Knowledge-Centered Systems, In press, pp.1-38
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- RNA sequencing data for responses to drought stress and/or clubroot infection in developing seeds of Brassica napus
- auteur
- Grégoire Bianchetti, Vanessa Clouet, Fabrice Legeai, Cécile Baron, Kévin Gazengel, Aurélien Carrillo, Maria M. Manzanares-Dauleux, Julia J Buitink, Nathalie Nesi
- article
- Data in Brief, 2021, 38, pp.1-11. ⟨10.1016/j.dib.2021.107392⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Constructing xenobiotic maps of metabolism to predict enzymes catalyzing metabolites capable of binding to DNA
- auteur
- Mael Conan, Nathalie Theret, Sophie Langouet, Anne Siegel
- article
- BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), pp.1-26. ⟨10.1186/s12859-021-04363-6⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Plant‐phenotypic changes induced by parasitoid ichnoviruses enhance the performance of both unparasitized and parasitized caterpillars
- auteur
- Antonino Cusumano, S Urbach, Fabrice Legeai, Marc Ravallec, Marcel Dicke, Erik Poelman, Anne‐nathalie Volkoff
- article
- Molecular Ecology, 2021, 30 (18), pp.4567-4583. ⟨10.1111/mec.16072⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Computing How-provenance for SPARQL queries via Query Rewriting
- auteur
- Luis Galárraga, Daniel Hernández, Katja Hose
- article
- Proceedings of the VLDB Endowment (PVLDB), 2021, 14 (13), pp.3389-3401. ⟨10.14778/3484224.3484235⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- When subsistence fishing meets conservation issues: Survey of a small fishery in a neotropical river with high biodiversity value
- auteur
- Guillaume Longin, Guy Fontenelle, Louis Bonneau de Beaufort, Chrystelle Delord, Sophie Launay, Raphaëlle Rinaldo, Gilles Lassalle, Pierre-Yves Le Bail, Jean-Marc Roussel
- article
- Fisheries Research, 2021, 241, pp.1-9. ⟨10.1016/j.fishres.2021.105995⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- StrainFLAIR: strain-level profiling of metagenomic samples using variation graphs
- auteur
- Kévin da Silva, Nicolas Pons, Magali Berland, Florian Plaza Oñate, Mathieu Almeida, Pierre Peterlongo
- article
- PeerJ, 2021, 9, pp.e11884. ⟨10.7717/peerj.11884⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidence integration credal classification algorithm versus missing data distributions
- auteur
- Zuo-Wei Zhang, Zhe Liu, Zong-Fa Ma, Ji-Huan He, Xing-Yu Zhu
- article
- Information Sciences, 2021, 569, pp.39-54. ⟨10.1016/j.ins.2021.04.008⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparative Transcriptome Analysis Provides Insights into Response of Ulva compressa to Fluctuating Salinity Conditions
- auteur
- Qikun Xing, Guiqi Bi, Min Cao, Arnaud Belcour, Méziane Aite, Yunxiang Mao
- article
- Journal of Phycology, 2021, 57 (4), pp.1295-1308. ⟨10.1111/jpy.13167⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Proteo-Trancriptomic Analyses Reveal a Large Expansion of Metalloprotease-Like Proteins in Atypical Venom Vesicles of the Wasp Meteorus pulchricornis (Braconidae)
- auteur
- Jean-Luc Gatti, Maya Belghazi, Fabrice Legeai, Marc Ravallec, Marie Frayssinet, Stéphanie Robin, Djibril Aboubakar-Souna, Ramasamy Srinivasan, Manuele Tamò, Marylène Poirié, Anne-Nathalie Volkoff
- article
- Toxins, 2021, 13 (7), pp.1-36. ⟨10.3390/toxins13070502⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- AskoR, A R Package for Easy RNASeq Data Analysis
- auteur
- Susete Alves Carvalho, Kévin Gazengel, Anthony Bretaudeau, Stéphanie Robin, Stéphanie Daval, Fabrice Legeai
- article
- Proceedings of The 1st International Electronic Conference on Entomology, 2021, ⟨10.3390/iece-10646⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- La confidentialité différentielle, garante de l’anonymat
- auteur
- Tristan Allard, Louis Béziaud, Sébastien Gambs
- article
- Pour la science, 2021
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Transcriptome Profiling of Starvation in the Peripheral Chemosensory Organs of the Crop Pest Spodoptera littoralis Caterpillars
- auteur
- Erwan Poivet, Aurore Gallot, Nicolas Montagné, Pavel Senin, Christelle Monsempès, Fabrice Legeai, Emmanuelle Jacquin-Joly
- article
- Insects, 2021, 12 (7), pp.573. ⟨10.3390/insects12070573⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- LRez: C ++ API and toolkit for analyzing and managing Linked-Reads data
- auteur
- Pierre Morisse, Claire Lemaitre, Fabrice Legeai
- article
- Bioinformatics Advances, 2021, 1 (1), pp.1-4. ⟨10.1093/bioadv/vbab022⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Application of concepts of neighbours to knowledge graph completion
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- CODATA Data Science Journal, 2021, 4 (1), pp.1-28. ⟨10.3233/DS-200030⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of Streptococcus thermophilus Genes Specifically Expressed under Simulated Human Digestive Conditions Using R-IVET Technology
- auteur
- Ophélie Uriot, Mounira Kebouchi, Emilie Lorson, Wessam Galia, Sylvain Denis, Sandrine Chalancon, Zeeshan Hafeez, Emeline Roux, Magali Genay, Stéphanie Blanquet-Diot, Annie Dary-Mourot
- article
- Microorganisms, 2021, 9 (6), pp.1-26. ⟨10.3390/microorganisms9061113⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Robustness analysis of metabolic predictions in algal microbial communities based on different annotation pipelines
- auteur
- Elham Karimi, Enora Geslain, Arnaud Belcour, Clémence Frioux, Méziane Aite, Anne Siegel, Erwan Corre, Simon M Dittami
- article
- PeerJ, 2021, 9, pp.1-24. ⟨10.7717/peerj.11344⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Outpatient vagus nerve stimulation surgery in drug-resistant epilepsy patients with severe intellectual disability
- auteur
- Insafe Mezjan, Isabelle Gourfinkel-An, Vincent Degos, Stéphane Clemenceau, Vincent Navarro, Véronique Masson, Alexandre Carpentier, Bertrand Mathon
- article
- Epilepsy & Behavior, 2021, 118, pp.1-4. ⟨10.1016/j.yebeh.2021.107931⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards Fully-fledged Archiving for RDF Datasets
- auteur
- Olivier Pelgrin, Luis Galárraga, Katja Hose
- article
- Semantic Web – Interoperability, Usability, Applicability, 2021, 12 (6), pp.903-925. ⟨10.3233/SW-210434⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Incremental learning of iterated dependencies
- auteur
- Denis Béchet, Annie Foret
- article
- Machine Learning, 2021, ⟨10.1007/s10994-021-05947-2⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Converting disease maps into heavyweight ontologies: general methodology and application to Alzheimer’s disease
- auteur
- Vincent Henry, Ivan Moszer, Olivier Dameron, Laura Vila Xicota, Bruno Dubois, Marie-Claude Potier, Martin Hofmann-Apitius, Olivier Colliot
- article
- Database – The journal of Biological Databases and Curation, 2021, pp.1-33. ⟨10.1093/database/baab004⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic Evidential Clustering Algorithm
- auteur
- Zuowei Zhang, Zhe Liu, Arnaud Martin, Zhun-Ga Liu, Kuang Zhou
- article
- Knowledge-Based Systems, 2021, 213
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Chromosomal scale assembly of parasitic wasp genome reveals symbiotic virus colonization
- auteur
- Jérémy Gauthier, Hélène Boulain, Joke J F A van Vugt, Lyam Baudry, Emma Persyn, Jean-Marc Aury, Benjamin Noel, Anthony Bretaudeau, Fabrice Legeai, Sven Warris, Mohamed A Chebbi, Géraldine Dubreuil, Bernard Duvic, Natacha Kremer, Philippe Gayral, Karine Musset, Thibaut Josse, Diane Bigot, Christophe Bressac, Sébastien Moreau, Georges Périquet, Myriam Harry, Nicolas Montagne, Isabelle Boulogne, Mahnaz Sabeti-Azad, Martine Maïbèche, Thomas Chertemps, Frédérique Hilliou, David Siaussat, Joëlle Amselem, Isabelle Luyten, Claire Capdevielle-Dulac, Karine Labadie, Bruna Laís Merlin, Valérie Barbe, Jetske G de Boer, Martial Marbouty, Fernando Luis Cônsoli, Stéphane Dupas, Aurélie Hua-Van, Gaelle Le Goff, Annie Bézier, Emmanuelle Jacquin-Joly, James B Whitfield, Louise E M Vet, Hans M Smid, Laure Kaiser, Romain Koszul, Elisabeth Huguet, Elisabeth A. Herniou, Jean-Michel Drezen
- article
- Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.1-15. ⟨10.1038/s42003-020-01623-8⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Heterogeneous information fusion: combination of multiple supervised and unsupervised classification methods based on belief functions
- auteur
- Na Li, Arnaud Martin, Rémi Estival
- article
- Information Sciences, 2021, 544, pp.238-265
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cyanorak v2.1: a scalable information system dedicated to the visualization and expert curation of marine and brackish picocyanobacteria genomes
- auteur
- Laurence Garczarek, Ulysse Guyet, Hugo Doré, Gregory Farrant, Mark Hoebeke, Loraine Brillet-Guéguen, Antoine Bisch, Mathilde Ferrieux, Jukka Siltanen, Erwan Corre, Gildas Le corguillé, Morgane Ratin, Frances Pitt, Martin Ostrowski, Maël Conan, Anne Siegel, Karine Labadie, Jean-Marc Aury, Patrick Wincker, David Scanlan, Frédéric Partensky
- article
- Nucleic Acids Research, 2021, 49 (D1), pp.D667-D676. ⟨10.1093/nar/gkaa958⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A distance for evidential preferences with application to group decision making
- auteur
- Yiru Zhang, Tassadit Bouadi, Yewan Wang, Arnaud Martin
- article
- Information Sciences, 2021, 568, pp.113-132. ⟨10.1016/j.ins.2021.03.011⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Online forecasting of daily feed intake in lactating sows supported by offline time-series clustering, for precision livestock farming
- auteur
- Raphaël Gauthier, Christine Largouët, Laurence Rozé, Jean-Yves Dourmad
- article
- Computers and Electronics in Agriculture, 2021, 188, pp.106329. ⟨10.1016/j.compag.2021.106329⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Two repeated motifs enriched within some enhancers and origins of replication are bound by SETMAR isoforms in human colon cells
- auteur
- Aymeric Antoine-Lorquin, Peter Arensburger, Ahmed Arnaoty, Sassan Asgari, Martine Batailler, Linda Beauclair, Catherine Belleannée, Nicolas Buisine, Vincent Coustham, Serge Guyetant, Laura Helou, Thierry Lecomte, Bruno Pitard, Isabelle Stévant, Yves Bigot
- article
- Genomics, 2021, 113 (3), pp.1589-1604. ⟨10.1016/j.ygeno.2021.03.032⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Resurrection of Ancestral Malate Dehydrogenases Reveals the Evolutionary History of Halobacterial Proteins : Deciphering Gene Trajectories and Changes in Biochemical Properties
- auteur
- Samuel Blanquart, Mathieu Groussin, Aline Le Roy, Gergely J Szöllosi, Eric Girard, Bruno Franzetti, Manolo Gouy, Dominique Madern
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2021, 38 (9), pp.3754-3774. ⟨10.1093/molbev/msab146⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Rennes – une IA souveraine au service de la vie publique
- auteur
- Guillaume Gravier, Elisa Fromont, Nicolas Courty, Teddy Furon, Christine Guillemot, Paolo Robuffo Giordano
- article
- Bulletin de l’Association Française pour l’Intelligence Artificielle, 2021
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- PAX2GRAPHML: a Python library for large-scale regulation network analysis using BIOPAX
- auteur
- François Moreews, Hugo Simon, Anne Siegel, Florence Gondret, Emmanuelle Becker
- article
- Bioinformatics, 2021, 37 (24), pp.4889-4891. ⟨10.1093/bioinformatics/btab441⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Semi-Quantitative Targeted Gas Chromatography-Mass Spectrometry Profiling Supports a Late Side-Chain Reductase Cycloartenol-to-Cholesterol Biosynthesis Pathway in Brown Algae
- auteur
- Jean Girard, Goulven Lanneau, Ludovic Delage, Cédric Leroux, Arnaud Belcour, Jeanne Got, Jonas Collén, Catherine Boyen, Anne Siegel, Simon M Dittami, Catherine Leblanc, Gabriel V Markov
- article
- Frontiers in Plant Science, 2021, 12, pp.1-10. ⟨10.3389/fpls.2021.648426⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Fishers’ perceptions of river resources: case study of French Guiana native populations using contextual cognitive mapping
- auteur
- Guillaume Longin, Louis Bonneau de Beaufort, Guy Fontenelle, Raphaelle Rinaldo, Jean-Marc Roussel, Pierre-Yves Le Bail
- article
- Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, 2021, 45 (1), pp.5-20. ⟨10.26028/cybium/2021-451-001⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Effects of the environment and animal behavior on nutrient requirements for gestating sows: Future improvements in precision feeding
- auteur
- Charlotte Gaillard, Maëva Durand, Christine Largouët, Jean-Yves Dourmad, Céline Tallet
- article
- Animal Feed Science and Technology, 2021, 279, pp.1-17. ⟨10.1016/j.anifeedsci.2021.115034⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Identification of isolated or mixed strains from long reads: a challenge met on Streptococcus thermophilus using a MinION sequencer
- auteur
- Grégoire Siekaniec, Emeline Roux, Téo Lemane, Eric Guédon, Jacques Nicolas
- article
- Microbial Genomics, 2021, 7 (11), pp.1-14. ⟨10.1099/mgen.0.000654⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Re-optimization for Multi-objective Cloud Database Query Processing using Machine Learning
- auteur
- Chenxiao Wang, Zach Arani, Le Gruenwald, Laurent d’Orazio, Eleazar Leal
- article
- International Journal of Database Management Systems, 2021, 13 (1), pp.21 – 40. ⟨10.5121/ijdms.2021.13102⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Conference papers
- titre
- Categorial Dependency Grammars: Analysis and Learning (Invited Talk)
- auteur
- Denis Béchet, Annie Foret
- article
- Logic and Algorithms in Computational Linguistics 2021 (LACompLing2021), Dec 2021, Montpellier, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Towards Data-and-Innovation Driven Sustainable and Productive Agriculture: BIO-AGRI-WATCH as a Use Case Study
- auteur
- Asanee Kawtrakul, Hutchatai Chanlekha, Kitsana Waiyamai, Thanapat Kangkachit, Laurent d’Orazio, Dimitris Kotzinos, Dominique Laurent, Nicolas Spyratos
- article
- 2021 IEEE International Conference on Big Data (Big Data), Dec 2021, Orlando, United States. pp.3407-3415, ⟨10.1109/BIGDATA52589.2021.9671520⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Towards Data-and-Innovation Driven Sustainable and Productive Agriculture: BIO-AGRI-WATCH as a Use Case Study
- auteur
- Asanee Kawtrakul, Hutchatai Chanlekha, Kitsana Waiyamai, Thanapat Kangkachit, Laurent d’Orazio, Dimitris Kotzinos, Dominique Laurent, Nicolas Spyratos
- article
- Workshop on Smart Farming, Precision Agriculture, and Supply Chain (SmartFarm@BigData), Dec 2021, Virtuelle, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- ASSIST: Article eXtraction and statIstical AnalysiS
- auteur
- Justine Fouillé, Thi Lan Huong Nguyen, Baptiste Alix, Brett Becker, Matthieu Rochard, Hélène de Ribaupierre, Laurent d’Orazio
- article
- International Workshop on Data science for equality, inclusion and well-being challenges (DS4EIW@BigData), Dec 2021, Virtuelle, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Detecting Fake News Conspiracies with Multitask and Prompt-Based Learning
- auteur
- Cheikh Brahim El Vaigh, Thomas Girault, Cyrielle Mallart, Duc Hau Nguyen
- article
- MediaEval 2021 – MediaEval Multimedia Evaluation benchmark. Workshop, Dec 2021, Online, Netherlands. pp.1-3
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- MDSC: Modelling Distributed Stream Processing across the Edge-to-Cloud Continuum
- auteur
- Daniel Balouek-Thomert, Pedro Silva, Kevin Fauvel, Alexandru Costan, Gabriel Antoniu, Manish Parashar
- article
- DML-ICC 2021 workshop (held in conjunction with UCC 2021), Dec 2021, Leicester, United Kingdom
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- PDF-Distil: including Prediction Disagreements in Feature-based Distillation for object detection
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- BMVC 2021 – 32nd British Machine Vision Conference, Nov 2021, Virtual, United Kingdom. pp.1-13
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Discovering Useful Compact Sets of Sequential Rules in a Long Sequence
- auteur
- Erwan Bourrand, Luis Galárraga, Esther Galbrun, Elisa Fromont, Alexandre Termier
- article
- ICTAI 2021 – 33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2021, Virtual, United States. pp.1-5
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Prediction-Based Fleet Relocation for Free Floating Car Sharing Services
- auteur
- Gregory Martin, Matthieu Donain, Elisa Fromont, Tias Guns, Laurence Roze, Alexandre Termier
- article
- ICTAI 2021 – 33rd International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2021, Virtual, United States. pp.1-5
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Kartu-Verbs: A Semantic Web Base of Inflected Georgian Verb Forms to Bypass Georgian Verb Lemmatization Issues
- auteur
- Mireille Ducassé
- article
- XIX EURALEX conference, Nov 2021, Alexandroupolis, Greece
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Cost and Quality Assurance in Crowdsourcing Workflows (Extended Abstract)
- auteur
- Loïc Hélouët, Zoltan Miklos, Rituraj Singh
- article
- BDA 2021 – 37 eme Conférence sur la Gestion des Données – Principes, Technologies, Applications, Oct 2021, Paris, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Attaque par inférence d’appartenance sur des séries temporelles agrégées en utilisant la programmation par contraintes
- auteur
- Antonin Voyez, Tristan Allard, Gildas Avoine, Pierre Cauchois, Elisa Fromont, Matthieu Simonin
- article
- BDA 2021 – 37ème Conférence sur la Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications, Oct 2021, Paris, France. pp.1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Towards Faster Reformulation-based Query Answering on RDF Graphs with RDFS Ontologies
- auteur
- Maxime Buron, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué
- article
- International Semantic Web Conference (ISWC), Oct 2021, Online, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Ontology-Mediated Query Answering: Performance Challenges and Advances
- auteur
- Wafaa El Husseini, Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Hélène Jaudoin
- article
- International Semantic Web Conference (ISWC), Oct 2021, Online, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modèle crédibiliste pour l’échantillonnage en apprentissage actif
- auteur
- Daniel Zhu, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall, Vincent Lemaire
- article
- Rencontres francophones sur la logique floue et ses applications, Oct 2021, Paris, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Built Year Prediction from Buddha Face with Heterogeneous Labels
- auteur
- Yiming Qian, Cheikh Brahim El Vaigh, Yuta Nakashima, Benjamin Renoust, Hajime Nagahara, Yutaka Fujioka
- article
- SUMAC’21: 3rd Workshop on Structuring and Understanding of Multimedia heritAge Contents, Oct 2021, Chengdu, China. ⟨10.1145/3475720.3484441⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- TrieDF: Efficient In-memory Indexing for Metadata-augmented RDF
- auteur
- Olivier Pelgrin, Luis Galárraga, Katja Hose
- article
- 7th Workshop on Managing the Evolution and Preservation of the Data Web (MEPDaW) co-located with the 20th International Semantic Web Conference (ISWC 2021), Virtual event, October 25th, 2021, Oct 2021, Virtual Event, France. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast Unfolding of Credal Partitions in Evidential Clustering
- auteur
- Zuowei Zhang, Arnaud Martin, Zhunga Liu, Kuang Zhou, Yiru Zhang
- article
- 6th International Conference on Belief Functions, Oct 2021, Shanghai, China. pp.3-12, ⟨10.1007/978-3-030-88601-1_1⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Credal Clustering for Imbalanced Data
- auteur
- Zuowei Zhang, Zhunga Liu, Kuang Zhou, Arnaud Martin, Yiru Zhang
- article
- 6th International Conference on Belief Functions, Oct 2021, Shanghai, China. pp.13-21, ⟨10.1007/978-3-030-88601-1_2⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Evidential clustering based on transfer learning
- auteur
- Kuang Zhou, Mei Guo, Arnaud Martin
- article
- International Conference on Belief Functions, Oct 2021, Shanghai, China
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Validation of Smets’ hypothesis in the crowdsourcing environment
- auteur
- Constance Thierry, Arnaud Martin, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall
- article
- 6th International Conference on Belief Functions, Oct 2021, Shanghai, China
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genome-scale network reconstruction of the predominant cellulolytic rumen bacterium Fibrobacter succinogenes S85
- auteur
- Fakih Ibrahim, Jeanne Got, Anne Siegel, Evelyne Forano, Rafael Munoz Tamayo
- article
- 2021 – 12th International Symposium on Gut Microbiology, INRAE ; Rowett Institute UK, Oct 2021, En ligne, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Genome-scale network recostruction of the predominant cellulolytic rumen bacterium Fibrobacter succinogenes S85
- auteur
- Ibrahim Fakih, J. Got, Anne Siegel, Evelyne Forano, Rafael Muñoz-Tamayo
- article
- 12th International Symposium on Gut Microbiology, Oct 2021, Virtual conference, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- DataTime: a Framework to smoothly Integrate Past, Present and Future into Models
- auteur
- Gauthier Lyan, Jean-Marc Jézéquel, David Gross-Amblard, Benoit Combemale
- article
- MODELS 2021 – ACM/IEEE 24th International Conference on Model Driven Engineering Languages and Systems, Oct 2021, Fukuoka, Japan. pp.1-11
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- findere: fast and precise approximate membership query
- auteur
- Lucas Robidou, Pierre Peterlongo
- article
- SPIRE 2021 – The 28th annual Symposium on String Processing and Information Retrieval, Oct 2021, Lille / Virtual, France. ⟨10.1101/2021.05.31.446182⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- On the Quality of Compositional Prediction for Prospective Analytics on Graphs
- auteur
- Gauthier Lyan, David Gross-Amblard, Jean-Marc Jézéquel
- article
- DaWaK 2021 – 23rd International Conference on Big Data Analytics and Knowledge Discovery, Sep 2021, Linz, Austria. pp.91-105, ⟨10.1007/978-3-030-87101-7_10⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Conversational recommendations for job recruiters
- auteur
- François Mentec, Zoltán Miklós, Sébastien Hervieu, Thierry Roger
- article
- Knowledge-aware and Conversational Recommender Systems, Sep 2021, Amsterdam, Netherlands
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Metabolic complementarity applied to the screening of microbiota and the identification of key species
- auteur
- Clémence Frioux, Arnaud Belcour, Méziane Aite, Anthony Bretaudeau, Falk Hildebrand, Anne Siegel
- article
- CMSB 2021 – 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2021, Bordeaux, France. pp.1-27
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Learning Boolean controls in regulated metabolic networks: a case-study
- auteur
- Kerian Thuillier, Caroline Baroukh, Alexander Bockmayr, Ludovic Cottret, Loïc Paulevé, Anne Siegel
- article
- CMSB 2021 – 19th International Conference on Computational Methods in Systems Biology, Sep 2021, Bordeaux, France. pp.159-180, ⟨10.1007/978-3-030-85633-5_10⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analytical Queries on Vanilla RDF Graphs with a Guided Query Builder Approach
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- FQAS 2021 – Flexible Query Answering Systems, Sep 2021, Bratislava, Slovakia
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Well-founded Graph-based Summarization Framework for Description Logics
- auteur
- Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué
- article
- International worshop on Description Logics, Sep 2021, Bratislava, Slovakia
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Deep Active Learning from Multispectral Data Through Cross-Modality Prediction Inconsistency
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- ICIP 2021 – 28th IEEE International Conference on Image Processing, Sep 2021, Anchorage, United States. pp.1-5, ⟨10.1109/ICIP42928.2021.9506322⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Temporal phenotyping for characterisation of hospital care pathways of COVID19 patients
- auteur
- Mathieu Chambard, Thomas Guyet, Yên-Lan Nguyen, Etienne Audureau
- article
- AALTD 2021 – The 6th International Workshop on Advanced Analytics and Learning on Temporal Data, Sep 2021, Bilbao / Virtual, Spain. pp.1-16
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Classification of Anomaly Explanation Methods
- auteur
- Véronne Yepmo, Grégory Smits, Olivier Pivert
- article
- Advances in Interpretable Machine Learning and Artificial Intelligence (AIMLAI), Sep 2021, (Online), France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidential Nearest Neighbours in Active Learning
- auteur
- Daniel Zhu, Arnaud Martin, Yolande Le Gall, Jean-Christophe Dubois, Vincent Lemaire
- article
- Worksop on Interactive Adaptive Learning (IAL) – ECML-PKDD, Sep 2021, Bilbao, Spain
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Adding Structure and Removing Duplicates in SPARQL Results with Nested Tables
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- Further with Knowledge Graphs (SEMANTiCS), Sep 2021, Amsterdam, Netherlands
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Channel Model with Memory for DNA Data Storage with Nanopore Sequencing
- auteur
- Belaid Hamoum, Elsa Dupraz, Laura Conde-Canencia, Dominique Lavenier
- article
- ISTC 2021: 11th International Symposium on Topics in Coding, Aug 2021, Montreal, Canada. pp.1-5, ⟨10.1109/ISTC49272.2021.9594243⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GCNBoost: Artwork Classification by Label Propagation through a Knowledge Graph
- auteur
- Cheikh Brahim El Vaigh, Noa Garcia, Benjamin Renoust, Chenhui Chu, Yuta Nakashima, Hajime Nagahara
- article
- ICMR 2021 – ACM International Conference on Multimedia Retrieval, Aug 2021, Taipei, Taiwan
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Compressing and Indexing Aligned Readsets
- auteur
- Travis Gagie, Garance Gourdel, Giovanni Manzini
- article
- WABI 2021 – Workshop on Algorithms in Bioinformatics, Aug 2021, Online conference, France. pp.1-21, ⟨10.4230/LIPIcs.WABI.2021.13⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Metabolic complementarity applied to the screening of microbiota and the identification of key species
- auteur
- Clémence Frioux, Arnaud Belcour, Méziane Aite, Anthony Bretaudeau, Falk Hildebrand, Anne Siegel
- article
- MPA 2021 – 8th Metabolic Pathway Analysis, Aug 2021, Knoxville, TN, United States. pp.1-27
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Approximate Hashing for Bioinformatics
- auteur
- Guy Arbitman, Shmuel T Klein, Pierre Peterlongo, Dana Shapira
- article
- CIAA 2021 – 25th International Conference on Implementation and Application of Automata, Jul 2021, Bremen, Germany. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Probabilistic forecasting of seasonal time series Combining clustering and classification for forecasting
- auteur
- Colin Leverger, Thomas Guyet, Simon Malinowski, Vincent Lemaire, Alexis Bondu, Laurence Rozé, Alexandre Termier, Régis Marguerie
- article
- ITISE 2021 – 7th International Conference on Time Series and Forecasting, Jul 2021, Gran Canaria, Spain. pp.1-13
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Parametric Graph for Unimodal Ranking Bandit
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Elisa Fromont, Boammani Aser Lompo
- article
- ICML 2021 – International Conference on Machine Learning, Jul 2021, Virtual, Canada. pp.3630–3639
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimal de novo assemblies for chloroplast genomes based on inverted repeats patterns
- auteur
- Rumen Andonov, Victor Epain, Dominique Lavenier
- article
- BiATA 2021 – 4th International conference Bioinformatics: from Algorithms to Applications, Jul 2021, St. Petersbourg, Russia. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MASCARA-FPGA cooperation model: Query Trimming through accelerators
- auteur
- van Long Nguyen Huu, Julien Lallet, Emmanuel Casseau, Laurent d’Orazio
- article
- SSDBM 2021 – 33rd International Conference on Scientific and Statistical Database Management, Jul 2021, Tampa, United States. pp.203-208, ⟨10.1145/3468791.3468795⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- LEVIATHAN: efficient discovery of large structural variants by leveraging long-range information from Linked-Reads data
- auteur
- Pierre Morisse, Fabrice Legeai, Claire Lemaitre
- article
- JOBIM 2021 – Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MTG-Link: filling gaps in draft genome assemblies with linked read data
- auteur
- Anne Guichard, Fabrice Legeai, Denis Tagu, Claire Lemaitre
- article
- JOBIM 2021 – Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Metabolic complementarity applied to the screening of microbiota and the identification of key species
- auteur
- Clémence Frioux, Arnaud Belcour, Meziane Aite, Anthony Bretaudeau, Falk Hildebrand, Anne Siegel
- article
- JOBIM 2021 – Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- GraphUnzip: unzipping assembly graphs with long reads and Hi-C
- auteur
- Roland Faure, Nadège Guiglielmoni, Jean-François Flot
- article
- JOBIM 2021 – Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France. pp.1-7
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Skyline Groups Are Ideals. An Efficient Algorithm for Enumerating Skyline Groups
- auteur
- Simon Coumes, Tassadit Bouadi, Lhouari Nourine, Alexandre Termier
- article
- IWOCA 2021 – 32nd International Workshop on Combinatorial Algorithms, Jul 2021, Ottawa, Canada. pp.223-236, ⟨10.1007/978-3-030-79987-8_16⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- AskoR, A R Package for Easy RNASeq Data Analysis
- auteur
- Susete Alves Carvalho, Kévin Gazengel, Anthony Bretaudeau, Stéphanie Robin, Stéphanie Daval, Fabrice Legeai
- article
- IECE 2021 – 1st International Electronic Conference on Entomology, Jul 2021, Virtual, France. pp.1-8, ⟨10.3390/IECE-10646⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extraction de sous-groupes exceptionnels de séries temporelles
- auteur
- Josie Signe
- article
- RJCIA 2021 – Rencontres des Jeunes Chercheurs en Intelligence Artificielle, Jul 2021, Bordeaux / Virtual, France. pp.89-90
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extracting Relations in Texts with Concepts of Neighbours
- auteur
- H. Ambre Ayats, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- International Conference In Formal Concepts Analysis, Jun 2021, Strasbourg, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An open generator of synthetic administrative healthcare databases
- auteur
- Thomas Guyet, Tristan Allard, Johanne Bakalara, Olivier Dameron
- article
- IAS 2021 – Atelier Intelligence Artificielle et Santé, Jun 2021, Bordeaux (virtuel), France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cost and Quality in Crowdsourcing Workflows
- auteur
- Loïc Hélouët, Zoltan Miklos, Rituraj Singh
- article
- PETRI NETS 2021 – 42nd International Conference on Applications and Theory of Petri Nets and Concurrency, Jun 2021, Paris, France. pp.33-54, ⟨10.1007/978-3-030-76983-3_3⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cloud Query Processing with Reinforcement Learning-based Multi-Objective Re-optimization
- auteur
- Chenxiao Wang, Le Gruenwald, Laurent d’Orazio, Eleazar Leal
- article
- International Conference on Model & Data Engineering (MEDI), Jun 2021, Tallinn, Estonia
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Ordonnancement d’objets par bandits unimodaux sur des graphes paramétriques
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Elisa Fromont, Aser Boammani Lompo
- article
- CAp 2021 – Conférence sur l’Apprentissage automatique, Jun 2021, Saint-Etienne (en ligne), France. pp.1
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Siame-se(3): regression in se(3) for end-to-end visual servoing
- auteur
- Samuel Felton, Elisa Fromont, Eric Marchand
- article
- ICRA 2021 – IEEE International Conference on Robotics and Automation, May 2021, Xi’an, China. pp.14454-14460
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- HiPaR: Hierarchical Pattern-Aided Regression
- auteur
- Luis Galárraga, Olivier Pelgrin, Alexandre Termier
- article
- PAKDD 2021 – Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, May 2021, Virtual, France. pp.320-332, ⟨10.1007/978-3-030-75762-5_26⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Showing Academic Performance Predictions during Term Planning: Effects on Students’ Decisions, Behaviors, and Preferences
- auteur
- Luis Galárraga, Gonzalo Mendez, Katherine Chiluiza
- article
- CHI 2021 – ACM CHI Conference on Human Factors in Computing Systems, May 2021, Yokohama, Japan. pp.1-17, ⟨10.1145/3411764.3445718⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Bandit Algorithm for Both Unknown Best Position and Best Item Display on Web Pages
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Elisa Fromont
- article
- IDA 2021 – 19th International Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2021, Porto (virtual), Portugal. pp.12
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Separ: Towards Regulating Future of Work Multi-Platform Crowdworking Environments with Privacy Guarantees
- auteur
- Mohammad Javad Amiri, Joris Duguépéroux, Tristan Allard, Divyakant Agrawal, Amr El Abbadi
- article
- The Web Conference 2021 (WWW ’21), Apr 2021, Ljubljana, Slovenia. ⟨10.1145/3442381.3449858⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- BrFAST: a Tool to Select Browser Fingerprinting Attributes for Web Authentication According to a Usability-Security Trade-off
- auteur
- Nampoina Andriamilanto, Tristan Allard
- article
- Companion Proceedings of the Web Conference 2021 (WWW ’21 Companion), Apr 2021, Ljubljana, Slovenia. ⟨10.1145/3442442.3458610⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- FRESQUE: A Scalable Ingestion Framework for Secure Range Query Processing on Clouds
- auteur
- Hoang van Tran, Tristan Allard, Laurent d’Orazio, Amr El Abbadi
- article
- EDBT 2021 – 24th International Conference on Extending Database Technology, Mar 2021, Nicosia, Cyprus. ⟨10.5441/002/edbt.2021.19⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- GraphMDL+: Interleaving the Generation and MDL-based Selection of Graph Patterns
- auteur
- Francesco Bariatti, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- SAC ’21: The 36th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing, Mar 2021, Virtual Event, South Korea. pp.355-363, ⟨10.1145/3412841.3441917⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- An extension of chronicles temporal model with taxonomies -Application to epidemiological studies
- auteur
- Johanne Bakalara, Thomas Guyet, Olivier Dameron, André Happe, Emmanuel Oger
- article
- HEALTHINF 2021 – 14th International Conference on Health Informatics, Feb 2021, online, France. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Passive Learning of Timed Automata from Logs (Student Abstract)
- auteur
- Lénaïg Cornanguer
- article
- AAAI 2021 – 35th AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2021, Vancouver (virtual), Canada. pp.15773-15774
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Algorithm for real-time prediction of daily feed intake in lactating sows
- auteur
- Raphaël Gauthier, Christine Largouët, Laurence Rozé, Jean-Yves Dourmad
- article
- 53. Journées de la Recherche Porcine, Ifip; Inrae, Feb 2021, En ligne, France. pp.127-132
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- A Performance-Explainability Framework to Benchmark Machine Learning Methods: Application to Multivariate Time Series Classifiers
- auteur
- Kevin Fauvel, Véronique Masson, Elisa Fromont
- article
- IJCAI-PRICAI 2020 – Workshop on Explainable Artificial Intelligence (XAI), Jan 2021, Yokohama, Japan. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Guided Attentive Feature Fusion for Multispectral Pedestrian Detection
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- WACV 2021 – IEEE Winter Conference on Applications of Computer Vision, Jan 2021, Waikoloa /Virtual, United States. pp.1-9, ⟨10.1109/WACV48630.2021.00012⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Requêtes flexibles avec des concepts disjonctifs
- auteur
- Grégory Smits, Olivier Pivert, Marie-Jeanne Lesot, Ronald R Yager
- article
- Rencontres Francophones sur la Logique Floue et ses Applications (LFA), 2021, Paris, France
- typdoc
- Conference papers
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-
Book sections
- titre
- Unequal Singleton Pair Distance for Evidential Preference Clustering
- auteur
- Yiru Zhang, Arnaud Martin
- article
- Belief Functions: Theory and Applications, 12915, Springer International Publishing, pp.33-43, 2021, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-030-88601-1_4⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Towards Universal Logic: Gaggle Logics
- auteur
- Guillaume Aucher
- article
- Melvin Fitting. Selected Topics from Contemporary Logics, College Publications, pp.5 – 73, 2021, Landscapes in Logic, 978-1848903500
- typdoc
- Book sections
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Méthodes bioinformatiques pour l’étude des Variants de Structure avec des données de séquençages génomiques
- auteur
- Claire Lemaitre
- article
- Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2021
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
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-
Books
- titre
- Préface of Proceedings of the conference BDA’2021
- auteur
- Esther Pacitti, Zoltan Miklos
- article
- 2021
- typdoc
- Books
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-
- titre
- Les décodeuses du numérique
- auteur
- Léa Castor, Célia Esnoult, Laure Thiébault, Ali Charara, Olivier Serre, Anne Siegel
- article
- CNRS Editions, 2021, 2271139481
- typdoc
- Books
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-
- titre
- Data science pour l’agriculture et l’environnement – Méthodes et applications avec R et Python
- auteur
- David Makowski, François Brun, Elodie Doutart, Florent Duyme, Mohammed El Jabri, Kevin Fauvel, Maxime Legris, Aurore Philibert, François Piraux, Alexandre Termier
- article
- Ellipses, 2021, Formations & Techniques, 9782340045774
- typdoc
- Books
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-
Theses
- titre
- To compare gene structures for prediction of alternative coding transcripts in human, mouse and dog
- auteur
- Nicolas Guillaudeux
- article
- Autre [cs.OH]. Université Rennes 1, 2021. Français. ⟨NNT : 2021REN1S079⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evaluation of the quality of contributions and contributors on crowdsourcing platforms
- auteur
- Constance Thierry
- article
- Informatique [cs]. Université de Rennes 1, 2021. Français. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Multispectral object detection
- auteur
- Heng Zhang
- article
- Other [cs.OH]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S099⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Identification of strains of a bacterial species from long reads
- auteur
- Grégoire Romain Siekaniec
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S083⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Mining Tractable Sets of Graph Patterns with the Minimum Description Length Principle
- auteur
- Francesco Bariatti
- article
- Computer Science [cs]. Université de Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Urban mobility : leveraging machine learning and data masses for the building of simulators
- auteur
- Gauthier Lyan
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S056⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Interpretable time series classification
- auteur
- Yichang Wang
- article
- Neural and Evolutionary Computing [cs.NE]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S052⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Predictive approach to asses the genotoxicity of environmental contaminants
- auteur
- Maël Conan
- article
- Génétique. Université de Rennes, 2021. Français. ⟨NNT : 2021REN1B010⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Comparison of homologous protein sequences using direct coupling information by pairwise Potts model alignments
- auteur
- Hugo Talibart
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université de Rennes, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S031⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Content and data linking leveraging ontological knowledge in data journalism
- auteur
- Cheikh Brahim El Vaigh
- article
- Computer Science [cs]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S001⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hierarchical and temporal analysis of scientific corpora as tools for the history of science
- auteur
- Ian Jeantet
- article
- Information Retrieval [cs.IR]. Université Rennes 1, 2021. English. ⟨NNT : 2021REN1S048⟩
- typdoc
- Theses
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-
2020
Journal articles
- titre
- Metage2Metabo, microbiota-scale metabolic complementarity for the identification of key species
- auteur
- Arnaud Belcour, Clémence Frioux, Méziane Aite, Anthony Bretaudeau, Falk Hildebrand, Anne Siegel
- article
- eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.61968⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cytosine methylation of mature microRNAs inhibits their functions and is associated with poor prognosis in glioblastoma multiforme
- auteur
- Mathilde Cheray, Amandine Etcheverry, Camille Jacques, Romain Pacaud, Gwenola Bougras-Cartron, Marc Aubry, Florent Denoual, Pierre Peterlongo, Arulraj Nadaradjane, Josephine Briand, Farida Akcha, Dominique Heymann, François M Vallette, Jean Mosser, Benjamin Ory, Pierre-Francois Cartron
- article
- Molecular Cancer, 2020, 19 (1), pp.1-36. ⟨10.1186/s12943-020-01155-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Functional insights from the GC-poor genomes of two aphid parasitoids, « Aphidius ervi » and « Lysiphlebus fabarum
- auteur
- Alice Dennis, Gabriel Ballesteros, Stéphanie Robin, Lukas Schrader, Jens Bast, Jan Berghöfer, Leo Beukeboom, Maya Belghazi, Anthony Bretaudeau, Jan Buellesbach, Elizabeth Cash, Dominique Colinet, Zoé Dumas, Mohammed Errbii, Patrizia Falabella, Jean-Luc Gatti, Elzemiek Geuverink, Joshua Gibson, Corinne Hertaeg, Stefanie Hartmann, Emmanuelle Jacquin-Joly, Mark Lammers, Blas Lavandero, Ina Lindenbaum, Lauriane Massardier-Galatà, Camille Meslin, Nicolas Montagné, Nina Pak, Marylène Poirié, Rosanna Salvia, Denis Tagu, Sophie Tares, Heiko Vogel, Tanja Schwander, Jean-Christophe Simon, Christian Figueroa, Christoph Vorburger, Fabrice Legeai, Jürgen Gadau, R.Chris Smith
- article
- BMC Genomics, 2020, 21 (Art. 376), pp.1-27. ⟨10.1186/s12864-020-6764-0⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genomic architecture of endogenous ichnoviruses reveals distinct evolutionary pathways leading to virus domestication in parasitic wasps
- auteur
- Fabrice F. Legeai, Bernardo F Santos, Stéphanie Robin, Anthony Bretaudeau, Rebecca B Dikow, Claire Lemaitre, Véronique Jouan, Marc Ravallec, Jean-Michel Drezen, Denis Tagu, Frédéric Baudat, Gabor Gyapay, Xin Zhou, Shanlin Liu, Bruce A Webb, Seán Brady, Anne-Nathalie Volkoff
- article
- BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.1-23. ⟨10.1186/s12915-020-00822-3⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards Universal Logic: Gaggle Logics
- auteur
- Guillaume Aucher
- article
- Journal of Applied Logics – IfCoLoG Journal of Logics and their Applications, 2020, 7 (6), pp.875-945
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How to interact with medical terminologies? Formative usability evaluations comparing three approaches for supporting the use of MedDRA by pharmacovigilance specialists
- auteur
- Romaric Marcilly, Laura Douze, Sébastien Ferré, Bissan Audeh, Carlos Bobed, Agnès Lillo-Le Louet, Jean-Baptiste Lamy, Cedric Bousquet
- article
- BMC Medical Informatics and Decision Making, 2020, 20 (1), pp.261. ⟨10.1186/s12911-020-01280-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest
- auteur
- Claude Rispe, Fabrice Legeai, Paul Nabity, Rosa Fernández, Arinder Arora, Patrice Baa-Puyoulet, Celeste Banfill, Leticia Bao, Miquel Barberà, Maryem Bouallegue, Anthony Bretaudeau, Jennifer A. Brisson, Federica Calevro, Pierre Capy, Olivier Catrice, Thomas Chertemps, Carole Couture, Laurent Deliere, Angela Douglas, Keith Dufault-Thompson, Paula Escuer, Honglin Feng, Astrid Forneck, Toni Gabaldón, Roderic Guigó, Frédérique Hilliou, Silvia Hinojosa-Alvarez, Yi-Min Hsiao, Sylvie Hudaverdian, Emmanuelle Jacquin-Joly, Edward James, Spencer J. Johnston, Benjamin Joubard, Gaëlle Le Goff, Gaël Le Trionnaire, Pablo Librado, Shanlin Liu, Eric Lombaert, Hsiao-Ling Lu, Martine Maïbèche, Mohamed Makni, Marina Marcet-Houben, David Martinez-Torres, Camille Meslin, Nicolas Montagné, Nancy Moran, Daciana Papura, Nicolas Parisot, Yvan Rahbé, Mélanie Ribeiro Lopes, Aida Ripoll-Cladellas, Stéphanie Robin, Céline Roques, Celine Lopez-Roques, Pascale Roux, Julio Rozas, Alejandro Sanchez-Gracia, Jose Sánchez-Herrero, Didac Santesmasses, Iris Scatoni, Rémy-Félix Serre, Ming Tang, Wenhua Tian, Paul Umina, Manuella van Munster, Carole Vincent-Monégat, Joshua Wemmer, Alex Wilson, Ying Zhang, Chaoyang Zhao, Jing Zhao, Serena Zhao, Xin Zhou, François Delmotte, Denis Tagu
- article
- BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Genome-scale metabolic models of Microbacterium species isolated from a high altitude desert environment
- auteur
- Dinka Mandakovic, Ángela Cintolesi, Jonathan Maldonado, Sebastián Mendoza, Méziane Aite, Alexis Gaete, Francisco Saitua, Miguel Allende, Veronica Cambiazo, Anne Siegel, Alejandro Maass, Mauricio Gonzalez, Mauricio Latorre
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1-12. ⟨10.1038/s41598-020-62130-8⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Plasma microRNA signature in presymptomatic and symptomatic subjects with C9orf72-associated frontotemporal dementia and amyotrophic lateral sclerosis
- auteur
- Virgilio Kmetzsch, Vincent Anquetil, Dario Saracino, Daisy Rinaldi, Agnès Camuzat, Thomas Gareau, Ludmila Jornea, Sylvie Forlani, Philippe Couratier, David Wallon, Florence Pasquier, Noémie Robil, Pierre de La Grange, Ivan Moszer, Isabelle Le Ber, Olivier Colliot, Emmanuelle Becker
- article
- Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, 2020, 92 (5), pp.485-493. ⟨10.1136/jnnp-2020-324647⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Dynamic estimation and Grid partitioning approach for Multi-Objective Optimization Problems in medical cloud federations
- auteur
- Trung-Dung Le, Verena Kantere, Laurent d’Orazio
- article
- Transactions on Large-Scale Data- and Knowledge-Centered Systems, 2020
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Adaptation by copy number variation increases insecticide resistance in the fall armyworm
- auteur
- Sylvie Gimenez, Heba Abdelgaffar, Gaëlle Le Goff, Frédérique Hilliou, Carlos Blanco, Sabine Hänniger, Anthony Bretaudeau, Fabrice Legeai, Nicolas Nègre, Juan Luis Jurat-Fuentes, Emmanuelle d’Alençon, Kiwoong Nam
- article
- Communications Biology, 2020, 3 (1), pp.1-10. ⟨10.1038/s42003-020-01382-6⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a better understanding of the low recall of insertion variants with short-read based variant callers
- auteur
- Wesley J Delage, Julien Thevenon, Claire Lemaitre
- article
- BMC Genomics, 2020, 21 (762), ⟨10.1186/s12864-020-07125-5⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GDBAlive: a Temporal Graph Database Built on Top of a Columnar Data Store
- auteur
- Maria Massri, Philippe Raipin, Pierre Meye
- article
- Journal of advances in information technology, 2020
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- From Task Tuning to Task Assignment in Privacy-Preserving Crowdsourcing Platforms
- auteur
- Joris Duguépéroux, Tristan Allard
- article
- Transactions on Large-Scale Data- and Knowledge-Centered Systems, 2020, pp.67-107. ⟨10.1007/978-3-662-62271-1_3⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Big Genes, Small Effectors: Pea Aphid Cassette Effector Families Composed From Miniature Exons
- auteur
- Matthew Dommel, Jonghee Oh, Jose Carlos Huguet-Tapia, Endrick Guy, Hélène Boulain, Akiko Sugio, Marimuthu Murugan, Fabrice Legeai, Michelle Heck, Michael C. Smith, Frank White
- article
- Frontiers in Plant Science, 2020, 11, pp.1-11. ⟨10.3389/fpls.2020.01230⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MinYS: mine your symbiont by targeted genome assembly in symbiotic communities
- auteur
- Cervin Guyomar, Wesley Delage, Fabrice Legeai, Christophe Mougel, Jean-Christophe Simon, Claire Lemaitre
- article
- NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (3), pp.1-11. ⟨10.1093/nargab/lqaa047⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SVJedi: genotyping structural variations with long reads
- auteur
- Lolita Lecompte, Pierre Peterlongo, Dominique Lavenier, Claire Lemaitre
- article
- Bioinformatics, 2020, 36 (17), pp.4568-4575. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa527⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Selection following Gene Duplication Shapes Recent Genome Evolution in the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum
- auteur
- Rosa Fernández, Marina Marcet-Houben, Fabrice Legeai, Gautier Richard, Stéphanie Robin, Valentin Wucher, Cinta Pegueroles, Toni Gabaldón, Denis Tagu
- article
- Molecular Biology and Evolution, 2020, 37 (9), pp.2601-2615. ⟨10.1093/molbev/msaa110⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes
- auteur
- Stéphanie Daval, Kévin Gazengel, Arnaud Belcour, Juliette Linglin, Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt, Alain Sarniguet, Maria M. Manzanares-Dauleux, Lionel Lebreton, Christophe Mougel
- article
- Microbial Biotechnology, 2020, 13 (5), pp.1648-1672. ⟨10.1111/1751-7915.13634⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Innovative Approach to Predict DNA Adduct Formation of Environnemental Contaminants
- auteur
- Maël Conan, Sophie Langouët, Anne Siegel, Nathalie Theret
- article
- Environmental and Molecular Mutagenesis, 2020, 61 (S1), pp.58. ⟨10.1002/em.22405⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Whole genome sequence of the soybean aphid, Aphis glycines.
- auteur
- Jacob A Wenger, Bryan J Cassone, Fabrice Legeai, J Spencer Johnston, Raman Bansal, Ashley D Yates, Brad S Coates, Vitor a C Pavinato, Andy Michel
- article
- Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2020, 123, pp.102917. ⟨10.1016/j.ibmb.2017.01.005⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- Integration of miRNA‐regulatory networks in hepatic stellate cells identifies TIMP3 as a key factor in chronic liver disease
- auteur
- Fida Azar, Kevin Courtet, Bassil Dekky, Dominique Bonnier, Olivier Dameron, Alain Colige, Vincent Legagneux, Nathalie Theret
- article
- Liver International, 2020, 40 (8), pp.2021-2033. ⟨10.1111/liv.14476⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Synergic Effects of Temperature and Irradiance on the Physiology of the Marine Synechococcus Strain WH7803
- auteur
- Ulysse Guyet, Ngoc Thanh Nguyen, Hugo Doré, Julie Haguait, Justine Pittera, Maël Conan, Morgane Ratin, Erwan Corre, Gildas Le Corguillé, Loraine A Brillet-Guéguen, Mark M. Hoebeke, Christophe Six, Claudia Steglich, Anne Siegel, Damien Eveillard, Frédéric Partensky, Laurence Garczarek
- article
- Frontiers in Microbiology, 2020, 11, ⟨10.3389/fmicb.2020.01707⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- DiscoSnp-RAD: de novo detection of small variants for RAD-Seq population genomics
- auteur
- Jérémy Gauthier, Charlotte Mouden, Tomasz Suchan, Nadir Alvarez, Nils Arrigo, Chloé Riou, Claire Lemaitre, Pierre Peterlongo
- article
- PeerJ, 2020, pp.1-20. ⟨10.7717/peerj.9291⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Using automated reasoning to explore the metabolism of unconventional organisms: a first step to explore host–microbial interactions
- auteur
- Clémence Frioux, Simon Dittami, Anne Siegel
- article
- Biochemical Society Transactions, 2020, 48 (3), pp.901-913. ⟨10.1042/BST20190667⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- RDF graph summarization for first-sight structure discovery
- auteur
- François Goasdoué, Pawel Guzewicz, Ioana Manolescu
- article
- The VLDB Journal, 2020, 29 (5), pp.1191-1218. ⟨10.1007/s00778-020-00611-y⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Extracellular vesicles produced by human and animal Staphylococcus aureus strains share a highly conserved core proteome
- auteur
- Natayme Rocha Tartaglia, Aurélie Nicolas, Vinicius de Rezende Rodovalho, Brenda Silva Rosa Da Luz, Valérie Briard-Bion, Zuzana Krupova, Anne Thierry, François Coste, Agnès Burel, Patrice P. Martin, Julien Jardin, Vasco Azevedo, Yves Le Loir, Eric Guédon
- article
- Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-020-64952-y⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Contrasting genomic and phenotypic outcomes of hybridization between pairs of mimetic butterfly taxa across a suture zone
- auteur
- Jérémy Gauthier, Donna Lisa De‐silva, Zachariah Gompert, Annabel Whibley, Céline Houssin, Yann Le Poul, Melanie Mcclure, Claire Lemaitre, Fabrice Legeai, James Mallet, Marianne Elias
- article
- Molecular Ecology, 2020, 29 (7), pp.1328-1343. ⟨10.1111/mec.15403⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A resource-frugal probabilistic dictionary and applications in bioinformatics
- auteur
- Camille Marchet, Lolita Lecompte, Antoine Limasset, Lucie Bittner, Pierre Peterlongo
- article
- Discrete Applied Mathematics, 2020, 92-102 (Volume 274), ⟨10.1016/j.dam.2018.03.035⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Complete Genome Sequences of Two Strains of Streptococcus pyogenes Belonging to an Emergent Clade of the Genotype emm89 in Brittany, France
- auteur
- Marie Devaere, Sarrah Boukthir, Séverine Moullec, Emeline Roux, Dominique Lavenier, Ahmad Faili, Samer Kayal
- article
- Microbiology Resource Announcements, 2020, 9 (11), pp.e00129-20. ⟨10.1128/MRA.00129-20⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- ELECTOR : evaluator for long reads correction methods
- auteur
- Camille Marchet, Pierre Morisse, Lolita Lecompte, Arnaud Lefebvre, Thierry Lecroq, Pierre Peterlongo, Antoine Limasset
- article
- NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (1), pp.1-12. ⟨10.1093/nargab/lqz015⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Metabolic Complementarity Between a Brown Alga and Associated Cultivable Bacteria Provide Indications of Beneficial Interactions
- auteur
- Bertille Burgunter-Delamare, Hetty Kleinjan, Clémence Frioux, Enora Fremy, Margot Wagner, Erwan Corre, Alicia Le Salver, Cédric Leroux, Catherine Leblanc, Catherine Boyen, Anne Siegel, Simon Dittami
- article
- Frontiers in Marine Science, 2020, 7, pp.1-11. ⟨10.3389/fmars.2020.00085⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Inferring Biochemical Reactions and Metabolite Structures to Understand Metabolic Pathway Drift
- auteur
- Arnaud Belcour, Jean Girard, Méziane Aite, Ludovic Delage, Camille Trottier, Charlotte Marteau, Cédric J-J Leroux, Simon M. Dittami, Pierre Sauleau, Erwan Corre, Jacques Nicolas, Catherine Boyen, Catherine Leblanc, Jonas Collén, Anne Siegel, Gabriel V Markov
- article
- iScience, 2020, 23 (2), pp.100849. ⟨10.1016/j.isci.2020.100849⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- SimkaMin: fast and resource frugal de novo comparative metagenomics
- auteur
- Gaëtan Benoit, Mahendra Mariadassou, Stéphane Robin, Sophie Schbath, Pierre Peterlongo, Claire Lemaitre
- article
- Bioinformatics, 2020, 36 (4), pp.1-2. ⟨10.1093/bioinformatics/btz685⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Finding all maximal perfect haplotype blocks in linear time
- auteur
- Jarno N Alanko, Hideo Bannai, Bastien Cazaux, Pierre Peterlongo, Jens Stoye
- article
- Algorithms for Molecular Biology, 2020, pp.1-9. ⟨10.1186/s13015-020-0163-6⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Graph-FCA: An extension of formal concept analysis to knowledge graphs
- auteur
- Sébastien Ferré, Peggy Cellier
- article
- Discrete Applied Mathematics, 2020, 273 (5), pp.81-102. ⟨10.1016/j.dam.2019.03.003⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fuzzy quality-aware queries to graph databases
- auteur
- Olivier Pivert, Etienne Scholly, Grégory Smits, Virginie Thion
- article
- Information Sciences, 2020, 521, pp.160–173. ⟨10.1016/J.INS.2020.02.035⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au bibtex
-
- titre
- A pipeline to create predictive functional networks: application to the tumor progression of hepatocellular carcinoma
- auteur
- Maxime Folschette, Vincent Legagneux, Arnaud Poret, Lokmane Chebouba, Carito Guziolowski, Nathalie Théret
- article
- BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), pp.18. ⟨10.1186/s12859-019-3316-1⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- The genome of Ectocarpus subulatus – A highly stress-tolerant brown alga
- auteur
- Simon M. Dittami, Erwan Corre, Loraine Brillet-Guéguen, Agnieszka Lipinska, Noé Pontoizeau, Meziane Aite, Komlan Avia, Christophe Caron, Chung Hyun Cho, Jonas Collen, Alexandre Cormier, Ludovic Delage, Sylvie Doubleau, Clémence Frioux, Angélique Gobet, Irene González-Navarrete, Agnès Groisillier, Cécile Herve, Didier Jollivet, Hetty Kleinjan, Catherine Leblanc, Xi Liu, Dominique Marie, Gabriel V Markov, André E. Minoche, Misharl Monsoor, Pierre Péricard, Marie-Mathilde Perrineau, Akira F. Peters, Anne Siegel, Amandine Siméon, Camille Trottier, Hwan Su Yoon, Heinz Himmelbauer, Catherine Boyen, Thierry Tonon
- article
- Marine Genomics, 2020, 52, pp.100740. ⟨10.1016/j.margen.2020.100740⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Evidential positive opinion influence measures for viral marketing
- auteur
- Siwar Jendoubi, Arnaud Martin
- article
- Knowledge and Information Systems (KAIS), 2020, 62, pp.1037-1062. ⟨10.1007/s10115-019-01375-w⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Unveiling the implicit knowledge, one scenario at a time
- auteur
- Flavien Lécuyer, Valérie Gouranton, Aurélien Lamercerie, Adrien Reuzeau, Bruno Arnaldi, Benoît Caillaud
- article
- The Visual Computer, 2020, pp.1-12. ⟨10.1007/s00371-020-01904-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- NegPSpan: efficient extraction of negative sequential patterns with embedding constraints
- auteur
- Thomas Guyet, René Quiniou
- article
- Data Mining and Knowledge Discovery, 2020, 34, pp.563-609. ⟨10.1007/s10618-019-00672-w⟩
- typdoc
- Journal articles
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-
Conference papers
- titre
- Netspot: a simple Intrusion Detection System with statistical learning
- auteur
- Alban Siffer, Alexandre Termier, Pierre-Alain Fouque, Christine Largouët
- article
- TrustCom 2020 – IEEE 19th International Conference on Trust, Security and Privacy in Computing and Communications, Dec 2020, Guangzhou, China. ⟨10.1109/TrustCom50675.2020.00122⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Variant Calling Parallelization on Processor-in-Memory Architecture
- auteur
- Dominique Lavenier, Remy Cimadomo, Romaric Jodin
- article
- BIBM 2020 – IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, Dec 2020, Virtual, South Korea. pp.1-4
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Publication of court records: circumventing the privacy-transparency trade-off
- auteur
- Tristan Allard, Louis Béziaud, Sébastien Gambs
- article
- AICOL 2020 – 11th International Workshop on Artificial Intelligence and the Complexity of Legal Systems, in conjunction with JURIX 2020, Dec 2020, Virtual, Czech Republic
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- FPSelect: Low-Cost Browser Fingerprints for Mitigating Dictionary Attacks against Web Authentication Mechanisms
- auteur
- Nampoina Andriamilanto, Tristan Allard, Gaëtan Le Guelvouit
- article
- Annual Computer Security Applications Conference (ACSAC 2020), Dec 2020, Austin, United States. ⟨10.1145/3427228.3427297⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Localize to Classify and Classify to Localize: Mutual Guidance in Object Detection
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- ACCV 2020 – The 15th Asian Conference on Computer Vision, Nov 2020, Kyoto / Virtual, Japan. pp.1-15, ⟨10.1007/978-3-030-69538-5_7⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- How to use Model Checking for Diagnosing Fault Patterns in Petri nets
- auteur
- Johanne Bakalara, Yannick Pencolé, Audine Subias
- article
- WODES 2020 – 15th IFAC Workshop on Discrete Event Systems, Nov 2020, Virtual, Brazil. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Adversarial regularization for explainable-by-design time series classification
- auteur
- Yichang Wang, Rémi Emonet, Elisa Fromont, Simon Malinowski, Romain Tavenard
- article
- ICTAI 2020 – 32th International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2020, online, Greece. pp.1-9, ⟨10.1109/ICTAI50040.2020.00165⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Novel Path-based Entity Relatedness Measure for Efficient Collective Entity Linking
- auteur
- Cheikh Brahim El Vaigh, François Goasdoué, Guillaume Gravier, Pascale Sébillot
- article
- International Semantic Web Conference (ISWC), Nov 2020, Athens, Greece
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Revisiting RDF storage layouts for efficient query answering
- auteur
- Maxime Buron, François Goasdoué, Ioana Manolescu, Tayeb Merabti, Marie-Laure Mugnier
- article
- SSWS 2020 – 13th International Workshop on Scalable Semantic Web Knowledge Base Systems, Nov 2020, Athène, Greece. pp.17-32
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Proposal for Nested Results in SPARQL
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- ISWC 2020 Posters, Demos, and Industry Tracks, Nov 2020, Athens, Greece
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An extension of chronicles temporal model with taxonomies
- auteur
- Johanne Bakalara, Thomas Guyet, Olivier Dameron, André Happe, Emmanuel Oger
- article
- BDA 2020 – 36ème Conférence sur la Gestion des Données – Principes, Technologies et Applications, Oct 2020, Virtual, France. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Multispectral Fusion for Object Detection with Cyclic Fuse-and-Refine Blocks
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- ICIP 2020 – IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2020, Abou Dabi, United Arab Emirates. pp.1-5
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving Anchor-based Explanations
- auteur
- Julien Delaunay, Luis Galárraga, Christine Largouët
- article
- CIKM 2020 – 29th ACM International Conference on Information and Knowledge Management, Oct 2020, Galway / Virtual, Ireland. pp.3269-3272, ⟨10.1145/3340531.3417461⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- SYSBOOSTER, application of Data Science to surveillance of systems for detection or anticipation of dysfunctions or failures of systems
- auteur
- Alain Celisse, Olivier Gauriau, Margot Corréard, Jean-François Bouin, Lennart Priester, Ronald Naumann, Emmanuel Arbaretier, Michel Kaczmarek, Uwe Schmietainski, Hagen Friedrich
- article
- Congrès Lambda Mu 22 « Les risques au cœur des transitions » (e-congrès) – 22e Congrès de Maîtrise des Risques et de Sûreté de Fonctionnement, Institut pour la Maîtrise des Risques, Oct 2020, Le Havre (e-congrès), France. pp.1-9
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Expedition in the Update Universe
- auteur
- Guillaume Aucher
- article
- Dynamic Logic. New Trends and Applications. DaLi 2020., Oct 2020, Prague, Czech Republic. pp.1-16, ⟨10.1007/978-3-030-65840-3_1⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Generalized Chronicles for Temporal Sequence Classification
- auteur
- Thomas Guyet, Yann Dauxais
- article
- AALTD 2020 – International Workshop on Advanced Analytics and Learning on Temporal Data, Sep 2020, Ghent, Belgium. pp.30-45, ⟨10.1007/978-3-030-65742-0_3⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Reducing the Cost of Aggregation in Crowdsourcing
- auteur
- Rituraj Singh, Loïc Hélouët, Zoltan Miklos
- article
- Web Services – ICWS 2020 – 27th International Conference, Held as Part of the Services Conference Federation, SCF 2020, Sep 2020, Honolulu, United States. pp.77-95, ⟨10.1007/978-3-030-59618-7⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An Algebra of Deterministic Propositional Acceptance Automata (DPAA)
- auteur
- Aurélien Lamercerie, Benoît Caillaud
- article
- FDL 2020 – Forum on specification & Design Languages, Sep 2020, Kiel, Germany. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Student-oriented Tool to Support Course Selection in Academic Counseling Sessions
- auteur
- Jaime Castells, Poul-Doust Mohammad, Luis Galárraga, Gonzalo Méndez, Margarita Ortiz-Rojas, Alberto Jiménez
- article
- LAUR 2020 – Workshop on Adoption, Adaptation and Pilots of Learning Analytics in Under-represented Regions co-located with the 15th European Conference on Technology Enhanced Learning 2020, Sep 2020, Virtual Event, Germany. pp.1-10
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Graph-Theoretic Barcode Ordering Model for Linked-Reads
- auteur
- Yoann Dufresne, Chen Sun, Pierre Marijon, Dominique Lavenier, Cedric Chauve, Rayan Chikhi
- article
- WABI 2020 – 20th Workshop on Algorithms in Bioinformatics, Sep 2020, Pisa, Italy. pp.11 – 12, ⟨10.4230/LIPIcs.WABI.2020.11⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Integrating Writing Dynamics in CNN for Online Children Handwriting Recognition
- auteur
- Simon Corbillé, Elisa Fromont, Eric Anquetil, Pauline Nerdeux
- article
- 17th International Conference on Frontiers in Handwriting Recognition (ICFHR), Sep 2020, Dortmund, Germany
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MASCARA (ModulAr Semantic CAching fRAmework) towards FPGA acceleration for IoT Security monitoring
- auteur
- van Long Nguyen Huu, Julien Lallet, Emmanuel Casseau, Laurent d’Orazio
- article
- VLIoT 2020 – International Workshop on Very Large Internet of Things, Sep 2020, Tokyo, Japan. pp.14-23
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Obi-Wan: Ontology-Based RDF Integration of Heterogeneous Data
- auteur
- Maxime Buron, François Goasdoué, Ioana Manolescu, Marie-Laure Mugnier
- article
- VLDB 2020 – 46th International Conference on Very Large Data Bases, Aug 2020, Tokyo, Japan
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Declarative mining of negative sequential patterns
- auteur
- Philippe Besnard, Thomas Guyet
- article
- 1st Declarative Problem Solving Workshop (DPSW 2020) @ ECAI 2020, Pedro Cabalar (CITIC-Univ. A Coruña, Spain); Andreas Herzig (Tolouse Univ, France); David Pearce (Univ. Politécnica Madrid, Spain); Torsten Schaub (Univ. Potsdam, Germany); Stefan Woltran (Vienna Univ. Tech. Austria), Aug 2020, Santiago de Compostela, Spain. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Semantics of negative sequential patterns
- auteur
- Thomas Guyet, Philippe Besnard
- article
- 24 th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI 2020), European Association for Artificial Intelligence (EurAI); Spanish AI Society (AEPIA); University of Santiago de Compostela (CiTIUS), Aug 2020, Santiago de Compostela, Spain. pp.1-7
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Cooking related Carbon Footprint Evaluationand Optimisation
- auteur
- Damien Alvarez de Toledo, Laurent d’Orazio, Frédéric Andrès, Maria Leite
- article
- International Workshop on Intelligent Data – From Data to Knowledge (DOING 2020), Aug 2020, Lyon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Scored Semantic Cache Replacement Strategy for Mobile Cloud Database Systems
- auteur
- Zachary Arani, Drake Chapman, Chenxiao Wang, Le Gruenwald, Laurent d’Orazio, Taras Basiuk
- article
- International Workshop on BI & BIG DATA APPLICATIONS (BBIGAP) @ ADBIS, Aug 2020, Lyon, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Optimization for Large-Scale Fuzzy Joins Using Fuzzy Filters in MapReduce
- auteur
- Thi-To-Quyen Tran, Thuong-Cang Phan, Anne Laurent, Laurent d’Orazio
- article
- FUZZ-IEEE 2020 – International Conference on Fuzzy Systems, Jul 2020, Glasgow, United Kingdom. pp.1-8, ⟨10.1109/FUZZ48607.2020.9177610⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Online publication of court records: circumventing the privacy-transparency trade-off
- auteur
- Tristan Allard, Louis Béziaud, Sébastien Gambs
- article
- 1st International Workshop on Law and Machine Learning LML2020, in conjunction with ICML 2020, Jul 2020, Vienna, Austria
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Hybridation d’approches « transparentes » et basées « Deep Learning » pour l’analyse automatisée de productions graphiques d’élèves dans le contexte de l’éducation
- auteur
- Simon Corbillé, Eric Anquetil, Elisa Fromont
- article
- SIFED 2020 – Symposium International Francophone sur l’Ecrit et le Document, Jul 2020, En ligne, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Guess Who ? » Large-Scale Data-Centric Study of the Adequacy of Browser Fingerprints for Web Authentication
- auteur
- Nampoina Andriamilanto, Tristan Allard, Gaetan Le Guelvouit
- article
- International Conference on Innovative Mobile and Internet Services in Ubiquitous Computing (IMIS), Jul 2020, Lodz, Poland. pp.161-172, ⟨10.1007/978-3-030-50399-4_16⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Towards a better understanding of the low discovery rate of short-read based insertion variant callers
- auteur
- Wesley Delage, Julien Thevenon, Claire Lemaitre
- article
- JOBIM 2020 – Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2020, Montpellier, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ComPotts: Optimal alignment of coevolutionary models for protein sequences
- auteur
- Hugo Talibart, François Coste
- article
- JOBIM 2020 – Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2020, Montpellier, France. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Steps in the Representation of Concept Lattices and Median Graphs
- auteur
- Alain Gély, Miguel Couceiro, Laurent Miclet, Amedeo Napoli
- article
- CLA 2020 – 15th International Conference on Concept Lattices and Their Applications, Sadok Ben Yahia; Francisco José Valverde Albacete; Martin Trnecka, Jun 2020, Tallinn, Estonia. pp.1-11
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Transduction sémantique pour la modélisation de système
- auteur
- Aurélien Lamercerie
- article
- PFIA 2020 – Plate-Forme de l’Intelligence Artificielle (PFIA), rencontres RJCIA, Jun 2020, Angers, France. pp.1-6
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Practical comparison of FCA extensions to model indeterminate value of ternary data
- auteur
- Priscilla Keip, Sébastien Ferré, Alain Gutierrez, Marianne Huchard, Pierre Silvie, Pierre Martin
- article
- CLA 2020 – 15th International Conference on Concept Lattices and Their Applications, Jun 2020, Tallinn, Estonia. pp.197-208
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Data Centric Workflows for Crowdsourcing
- auteur
- Pierre Bourhis, Loïc Hélouët, Zoltan Miklos, Rituraj Singh
- article
- Petri Nets 2020 – 41st International Conference on Application and Theory of Petri Nets and Concurrency, Jun 2020, Paris, France. pp.1-39
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Méthodes de Fusion de Cartes de Caractéristiques pour la Détection Multispectrale par Réseaux de Neurones Profonds
- auteur
- Heng Zhang, Elisa Fromont, Sébastien Lefèvre, Bruno Avignon
- article
- RFIAP 2020 – Reconnaissance des Formes, Image, Apprentissage et Perception, Jun 2020, Vannes, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Bandits manchots avec échantillonnage de Thompson pour des recommandations multiples suivant un modèle fondé sur les positions
- auteur
- Camille-Sovanneary Gauthier, Romaric Gaudel, Elisa Fromont
- article
- CAp 2020 – Conférence sur l’Apprentissage automatique, Jun 2020, Vannes, France. pp.1-2
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Fast and Exact Rule Mining with AMIE 3
- auteur
- Jonathan Lajus, Luis Galárraga, Fabian Suchanek
- article
- ESWC 2020 – 17th International Semantic Web Conference, May 2020, Virtual Event, Greece. pp.36-52, ⟨10.1007/978-3-030-49461-2_3⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GraphMDL: Graph Pattern Selection based on Minimum Description Length
- auteur
- Francesco Bariatti, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- IDA 2020 – Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2020, Konstanz, Germany. ⟨10.1007/978-3-030-44584-3_5⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Overlapping Hierarchical Clustering (OHC)
- auteur
- Ian Jeantet, Zoltan Miklos, David Gross-Amblard
- article
- Inteligent Data Analysis (IDA 2020), Apr 2020, Konstanz, Germany
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Widening for MDL-based Retail Signature Discovery
- auteur
- Clément Gautrais, Peggy Cellier, Matthijs van Leeuwen, Alexandre Termier
- article
- IDA 2020 – Symposium on Intelligent Data Analysis, Apr 2020, Konstanz, Germany. pp.1-12
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Persistent Memory-Aware Buffer Pool Manager Simulator for Multi-Tenant Cloud Databases
- auteur
- Taras Basiuk, Le Gruenwald, Laurent d’Orazio, Eleazar Leal
- article
- International Workshop on Big Data Management on Emerging Hardware, Apr 2020, Dallas, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Think Cities: the accelerator for sustainable planning
- auteur
- Gwenaelle Carfantan, Florian Daniel, Laurent d’Orazio, Trung-Dung Le, Xavier Marin, Olivier Peau, Hervé Rannou
- article
- International Workshop on Data-Driven Smart Cities (DASC@ICDE), Apr 2020, Dallas, United States
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- REMI: Mining Intuitive Referring Expressions on Knowledge Bases
- auteur
- Luis Galárraga, Julien Delaunay, Jean-Louis Dessalles
- article
- EDBT 2020 – 23rd International Conference on Extending Database Technology, Mar 2020, Virtual Event, Denmark. pp.387-390, ⟨10.5441/002/edbt.2020.39⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Task-Tuning in Privacy-Preserving Crowdsourcing Platforms
- auteur
- Joris Duguépéroux, Antonin Voyez, Tristan Allard
- article
- International Conference on Extending Database Technology, Mar 2020, Copenhagen, Denmark. ⟨10.5441/002/edbt.2020.79⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Ontology-Based RDF Integration of Heterogeneous Data
- auteur
- Maxime Buron, François Goasdoué, Ioana Manolescu, Marie-Laure Mugnier
- article
- EDBT 2020 – 23rd International Conference on Extending Database Technology, Mar 2020, Copenhagen, Denmark. pp.299-310, ⟨10.5441/002/edbt.2020.27⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Distributed Multi-Sensor Machine Learning Approach to Earthquake Early Warning
- auteur
- Kevin Fauvel, Daniel Balouek-Thomert, Diego Melgar, Pedro Silva, Anthony Simonet, Gabriel Antoniu, Alexandru Costan, Véronique Masson, Manish Parashar, Ivan Rodero, Alexandre Termier
- article
- In Proceedings of the 34th AAAI Conference on Artificial Intelligence, Feb 2020, New York, United States. pp.403-411, ⟨10.1609/aaai.v34i01.5376⟩
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Profilage et prédiction : de l’usage des algorithmes en matière pénale
- auteur
- Laurent Rousvoal, Tristan Allard, Elisa Fromont
- article
- 2020 – Festival des libertés numériques, INSA Rennes, Université Rennes 2, URFIST de Rennes., Feb 2020, Rennes, France
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
- titre
- Construction guidée de requêtes analytiques sur des graphes RDF
- auteur
- Sébastien Ferré
- article
- Atelier Web des Données, Jan 2020, Bruxelles, Belgique
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- GraphMDL : sélection de motifs de graphes avec le principe MDL
- auteur
- Francesco Bariatti, Peggy Cellier, Sébastien Ferré
- article
- EGC 2020, Jan 2020, Bruxelles, Belgique
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Modelisation de l’incertitude et de l’imprecision de donnees de crowdsourcing : MONITOR
- auteur
- Constance Thierry, Jean-Christophe Dubois, Yolande Le Gall, Arnaud Martin
- article
- Extraction et Gestion des Connaissances (EGC), Jan 2020, Bruxelles, Belgique
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Énumération des occurrences d’une chronique
- auteur
- Thomas Guyet, Philippe Besnard, Ahmed Samet, Nasreddine Ben Salha, Nicolas Lachiche
- article
- EGC 2020 – 20ème édition de la Conférence Extraction et Gestion des Connaissances, Jan 2020, Bruxelles, Belgique. pp.253-260
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- ARES : un extracteur d’exigences pour la modélisation de systèmes
- auteur
- Aurélien Lamercerie
- article
- EGC 2020 – Extraction et Gestion des Connaissances (Atelier – Fouille de Textes – Text Mine), Jan 2020, Bruxelles, Belgique. pp.1-4
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Approximating Longest Common Substring with k mismatches: Theory and Practice
- auteur
- Garance Gourdel, Tomasz Kociumaka, Jakub Radoszewski, Tatiana Starikovskaya
- article
- CPM 2020 – 31st Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, 2020, Copenhagen, Denmark. ⟨10.4230/LIPIcs.CPM.2020.16⟩
- typdoc
- Conference papers
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-
Book sections
- titre
- Integrative models for TGF-$\beta$ signaling and extracellular matrix
- auteur
- Nathalie Theret, Jérôme Feret, Arran Hodgkinson, Pierre Boutillier, Pierre Vignet, Ovidiu Radulescu
- article
- Sylvie Ricard-Blum. Extracellular Matrix Omics, 7, Springer, pp.17, 2020, Biology of Extracellular Matrix, 978-3-030-58329-3. ⟨10.1007/978-3-030-58330-9_10⟩
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- IA et Bioinformatique
- auteur
- Jacques Nicolas
- article
- Sébastien Konieczny; Henri Prade. L’intelligence artificielle: De quoi s’agit-il vraiment ?, Cépaduès, pp.101, 2020, 9782364938502
- typdoc
- Book sections
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-
- titre
- Ouvrir la boîte noire des algorithmes de personnalisation
- auteur
- Tristan Allard, Louis Béziaud, Sébastien Gambs, Julien Lolive
- article
- Le profilage en ligne : entre libéralisme et régulation, Mare & Martin, 2020, Libre droit, 978-2-84934-466-8
- typdoc
- Book sections
- Accès au bibtex
-
- titre
- Formal Concept Analysis: From Knowledge Discovery to Knowledge Processing
- auteur
- Sébastien Ferré, Marianne Huchard, Mehdi Kaytoue, Sergei Kuznetsov, Amedeo Napoli
- article
- Pierre Marquis; Odile Papini; Henri Prade. A Guided Tour of Artificial Intelligence Research, 2, Springer International Publishing, pp.411-445, 2020, AI Algorithms, 978-3-030-06167-8. ⟨10.1007/978-3-030-06167-8_13⟩
- typdoc
- Book sections
- Accès au bibtex
-
- titre
- Artificial Intelligence and Bioinformatics
- auteur
- Jacques Nicolas
- article
- Marquis, P., Papini, O., Prade, H. A Guided Tour of Artificial Intelligence Research, III, Springer, pp.575, 2020, Interfaces and Applications of Artificial Intelligence, 978-3-030-06169-2
- typdoc
- Book sections
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- From databases to artificial intelligence
- auteur
- Zoltan Miklos
- article
- Databases [cs.DB]. Université de Rennes 1 [UR1], 2020
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
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-
- titre
- Enhancing sequential pattern mining with time and reasoning
- auteur
- Thomas Guyet
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université de Rennes 1, 2020
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
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-
Books
- titre
- Actes de l’atelier HIA 2020: Humains et IA, travailler en intelligence
- auteur
- David Gross-Amblard
- article
- 2020
- typdoc
- Books
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-
Theses
- titre
- Filters based fuzzy big joins
- auteur
- Thi To Quyen Tran
- article
- Databases [cs.DB]. Université Rennes 1; Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S070⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Leveraging browser fingerprinting for web authentication
- auteur
- Tompoariniaina Nampoina Andriamilanto
- article
- Systems and Control [cs.SY]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S045⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Identification of causal pathologic signature by multi-omic data integration
- auteur
- Méline Wery
- article
- Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2020. Français. ⟨NNT : 2020REN1S071⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Characterization and detection of large constitutional insertions for medical use
- auteur
- Wesley Delage
- article
- Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2020. Français. ⟨NNT : 2020REN1S049⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Structural variant genotyping with long read data
- auteur
- Lolita Lecompte
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S054⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Analysis and integration of heterogeneous large-scale genomics data
- auteur
- Marine Louarn
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
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-
- titre
- Analysis and integration of heterogeneous large-scale genomics data : application to B cell differentiation and follicular lymphoma non coding mutations
- auteur
- Marine Louarn
- article
- Bioinformatics [q-bio.QM]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S088⟩
- typdoc
- Theses
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- titre
- Investigation of a framework for seasonal time series forecasting
- auteur
- Colin Leverger
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université de Rennes, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S033⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Frequent itemset sampling of high throughput streams on FPGA accelerators
- auteur
- Maël Gueguen
- article
- Embedded Systems. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S053⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Enhancing Performance and Explainability of Multivariate Time Series Machine Learning Methods : Applications for Social Impact in Dairy Resource Monitoring and Earthquake Early Warning
- auteur
- Kevin Fauvel
- article
- Machine Learning [cs.LG]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S043⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Protecting workers in crowdsourcing platforms : a technical perspective
- auteur
- Joris Duguépéroux
- article
- Other [cs.OH]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S023⟩
- typdoc
- Theses
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- titre
- Combination of supervised and unsupervised classifiers based on belief functions
- auteur
- Na Li
- article
- Image Processing [eess.IV]. University of Rennes I, 2020. English. ⟨NNT : ⟩
- typdoc
- Theses
- Accès au texte intégral et bibtex
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- titre
- Modeling and management of imperfect preferences with the theory of belief functions
- auteur
- Yiru Zhang
- article
- Artificial Intelligence [cs.AI]. Université Rennes 1, 2020. English. ⟨NNT : 2020REN1S006⟩
- typdoc
- Theses
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